Transcript: AT5G02310.1 PRT6-202
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Description
proteolysis 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830916 ]
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PRT6-202 AT5G02310.1 6746 2006aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
F4KCC2 - A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical, PRT6-201 AT5G02310.2 6769 1924aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A1P8BFH3 - - PRT6-203 AT5G02310.3 6252 2006aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
F4KCC2 - -
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
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E--A--R--E--R--P--R--K--S--A--V--S--P--T--M--K--K--R--F--R-- AG AGC ATG AAT ATG CTG CAG TGG TTG ATG TTC CAG GAT GAG CCT GAT GTT TCT TTG AGG A AGAGCATGAATATGCTGCAGTGGTTGATGTTCCAGGATGAGCCTGATGTTTCTTTGAGGA E--S--M--N--M--L--Q--W--L--M--F--Q--D--E--P--D--V--S--L--R-- AT CTA GCA AAA CTG AAT CTT GAT CAG CGA GGT GTT TGT GGC TCT GTC TGG GGA CAG AAT G ATCTAGCAAAACTGAATCTTGATCAGCGAGGTGTTTGTGGCTCTGTCTGGGGACAGAATG N--L--A--K--L--N--L--D--Q--R--G--V--C--G--S--V--W--G--Q--N-- AT ATA GCA TAT AGG TGT AGG ACA TGC GAG AAT GAC CCA ACT TGT GCA ATC TGC GTG CCT T ATATAGCATATAGGTGTAGGACATGCGAGAATGACCCAACTTGTGCAATCTGCGTGCCTT D--I--A--Y--R--C--R--T--C--E--N--D--P--T--C--A--I--C--V--P-- GT TTC CAG AAT GGG GAT CAC AAC TCC CAC GAT TAT TCA ATC ATC TAC ACA GGT GGT GGT T GTTTCCAGAATGGGGATCACAACTCCCACGATTATTCAATCATCTACACAGGTGGTGGTT C--F--Q--N--G--D--H--N--S--H--D--Y--S--I--I--Y--T--G--G--G-- GT TGT GAT TGT GGG GAT GAA ACA GCA TGG AAA CCT GAT GGT TTC TGT TCA AAT CAT AAA G 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GGT ATA TCA AAG TTT CTT TGC AAG TTG TCC TCT TCT AGC GGC AGA A TAGGAAATGATGAAGGTATATCAAAGTTTCTTTGCAAGTTGTCCTCTTCTAGCGGCAGAA L--G--N--D--E--G--I--S--K--F--L--C--K--L--S--S--S--S--G--R-- AC ATC CCT GAA AGT AAG ATG TCG TGG CCA AGG AGA GAT TTG TTA AAT GTT GAA ACT GGA G ACATCCCTGAAAGTAAGATGTCGTGGCCAAGGAGAGATTTGTTAAATGTTGAAACTGGAG N--I--P--E--S--K--M--S--W--P--R--R--D--L--L--N--V--E--T--G-- GA AGT GTA TCT AGT AAT CTT GCC AGT TCT AGT AGA GAT CCG AGT ACT GGC TTA TCA CCT C GAAGTGTATCTAGTAATCTTGCCAGTTCTAGTAGAGATCCGAGTACTGGCTTATCACCTC G--S--V--S--S--N--L--A--S--S--S--R--D--P--S--T--G--L--S--P-- TA TGC GGC GAT ATT CAA ACA AAT CTT AGC TTG GAT AAT GTT TGT GGA CCG TAT GGG GTG G TATGCGGCGATATTCAAACAAATCTTAGCTTGGATAATGTTTGTGGACCGTATGGGGTGG L--C--G--D--I--Q--T--N--L--S--L--D--N--V--C--G--P--Y--G--V-- TT CAG ACA GAT GTT ACA GCT GAC TCT AAA AGA GTA TCT TGC AAC TCT GCT GAT TTG ACA A TTCAGACAGATGTTACAGCTGACTCTAAAAGAGTATCTTGCAACTCTGCTGATTTGACAA V--Q--T--D--V--T--A--D--S--K--R--V--S--C--N--S--A--D--L--T-- AG AAT GCA TCA GGA TTA CGT ATA CTT GGT CTG TGT GAT TGG CCG GAC ATT CAC TAT GAT G AGAATGCATCAGGATTACGTATACTTGGTCTGTGTGATTGGCCGGACATTCACTATGATG K--N--A--S--G--L--R--I--L--G--L--C--D--W--P--D--I--H--Y--D-- TG AGT TCT CAG GCC ATA TCA GTT CAT CTT CCT TTG CAC CGG TTA CTT TCT CTG CTA ATA C TGAGTTCTCAGGCCATATCAGTTCATCTTCCTTTGCACCGGTTACTTTCTCTGCTAATAC V--S--S--Q--A--I--S--V--H--L--P--L--H--R--L--L--S--L--L--I-- AA AAA GCA TTA AGG ATA TGT TAT GGA GAA TCT GCA TCA TAC AAT GGA GTC AGT ATT AGT C AAAAAGCATTAAGGATATGTTATGGAGAATCTGCATCATACAATGGAGTCAGTATTAGTC Q--K--A--L--R--I--C--Y--G--E--S--A--S--Y--N--G--V--S--I--S-- AT GAG ATC CCA CAT GCA GAC TTC TTC AGC TCC GTG ATA GGA GAT TTC CAT CCT TGT GGA T ATGAGATCCCACATGCAGACTTCTTCAGCTCCGTGATAGGAGATTTCCATCCTTGTGGAT H--E--I--P--H--A--D--F--F--S--S--V--I--G--D--F--H--P--C--G-- TT TCT GCA CTC GTT ATG GAA CAT GTT CTA CAG ATT AGG GTG TTT TGT GCC CAG GTT ATC G TTTCTGCACTCGTTATGGAACATGTTCTACAGATTAGGGTGTTTTGTGCCCAGGTTATCG F--S--A--L--V--M--E--H--V--L--Q--I--R--V--F--C--A--Q--V--I-- CT GGA ATG TGG AAG AAG AAT GGG GAT TCT GCA TTA GTA TCT TGT GAG TGG TAT CGG TCA G CTGGAATGTGGAAGAAGAATGGGGATTCTGCATTAGTATCTTGTGAGTGGTATCGGTCAG A--G--M--W--K--K--N--G--D--S--A--L--V--S--C--E--W--Y--R--S-- TT CGT TG G TCA GAA CAG GGA CTT GAG CTT GAT CTA TTT CTT CTC CAG TGT TGT GCT GCG T TTCGTTGGTCAGAACAGGGACTTGAGCTTGATCTATTTCTTCTCCAGTGTTGTGCTGCGT V--R--W--S--E--Q--G--L--E--L--D--L--F--L--L--Q--C--C--A--A-- TA GCT CCC GCA GAT TCT TAT GTT GAT AAG CTT CTC AGT CGA TTT GGG CTC TCA AGC TAT C TAGCTCCCGCAGATTCTTATGTTGATAAGCTTCTCAGTCGATTTGGGCTCTCAAGCTATC L--A--P--A--D--S--Y--V--D--K--L--L--S--R--F--G--L--S--S--Y-- TT TCA CTT AAT CCG GAT ATA ACA AAT GA G TAT GAA CCA GTT TTG GTC CAG GAA ATG CTT G TTTCACTTAATCCGGATATAACAAATGAGTATGAACCAGTTTTGGTCCAGGAAATGCTTG L--S--L--N--P--D--I--T--N--E--Y--E--P--V--L--V--Q--E--M--L-- GT CTT CTG ATA CAG ATT CTG CAA GAA AGA CGA TTT TGT GGT CTT TCT ACT GCT GAA AGT T 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CCG AGG TGG AGA A AAAGATTTTCGCGTTATTGTGGAGTGTCTGCGTTGACCACTCAGCTTCCGAGGTGGAGAA E--R--F--S--R--Y--C--G--V--S--A--L--T--T--Q--L--P--R--W--R-- TG ATC TAT CCA CCT CTA AAG GGG CTT GCT AGA ATA GGC ACT TGC AAA GCC ACA TTT CAA A TGATCTATCCACCTCTAAAGGGGCTTGCTAGAATAGGCACTTGCAAAGCCACATTTCAAA M--I--Y--P--P--L--K--G--L--A--R--I--G--T--C--K--A--T--F--Q-- TA ATT TCA TCT GCT TTA TAC TAC GCA CTA CAG AGT GGT ACA TCA GTT AAA TCA CGT GCT C TAATTTCATCTGCTTTATACTACGCACTACAGAGTGGTACATCAGTTAAATCACGTGCTC I--I--S--S--A--L--Y--Y--A--L--Q--S--G--T--S--V--K--S--R--A-- CT GAT GGT GTT CTC ATA ACT GCA CTG CAG TTA CTC TCG TTA TCA TTG GAT ATT TGC ACT C CTGATGGTGTTCTCATAACTGCACTGCAGTTACTCTCGTTATCATTGGATATTTGCACTC P--D--G--V--L--I--T--A--L--Q--L--L--S--L--S--L--D--I--C--T-- AG CAG AGG CAA TCT AAT AGT CAG GAT TGT TGC TTA GAA AAT TCA ATT CCA ATT CTC GAA T AGCAGAGGCAATCTAATAGTCAGGATTGTTGCTTAGAAAATTCAATTCCAATTCTCGAAT Q--Q--R--Q--S--N--S--Q--D--C--C--L--E--N--S--I--P--I--L--E-- TA GCT GGT CTG GAA ATA ATT GGT ATA GCT CAA GGG 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AG AAA AAT TCT GTT GGT GGT CCA TCT ACT TTG CAA GGT AGA TTT CCT GAT ATT CGA TCA A AGAAAAATTCTGTTGGTGGTCCATCTACTTTGCAAGGTAGATTTCCTGATATTCGATCAA E--K--N--S--V--G--G--P--S--T--L--Q--G--R--F--P--D--I--R--S-- GA CAA ACT TCC AGG CGT CCT GAT GCT GGT TCA GAT GGG TTT CAC CCT ATC GAC TGT GAT G GACAAACTTCCAGGCGTCCTGATGCTGGTTCAGATGGGTTTCACCCTATCGACTGTGATG R--Q--T--S--R--R--P--D--A--G--S--D--G--F--H--P--I--D--C--D-- GG GTT TAT CTT TCA TCA TGT GGA CAT GCT GTA CAT CAA AGC TGC CTT GAA CGA TAT TTA A GGGTTTATCTTTCATCATGTGGACATGCTGTACATCAAAGCTGCCTTGAACGATATTTAA G--V--Y--L--S--S--C--G--H--A--V--H--Q--S--C--L--E--R--Y--L-- AA TCC TTA AAG GAA AG G TCT GGC AGA AGA ACT GTC TTT GAA GGT GCA CAT ATT GTG GAT C AATCCTTAAAGGAAAGGTCTGGCAGAAGAACTGTCTTTGAAGGTGCACATATTGTGGATC K--S--L--K--E--R--S--G--R--R--T--V--F--E--G--A--H--I--V--D-- TA AAA AAG AAA GAA TTC CTG TGT CCT GTA TGC CGC CGA CTA GCC AAT TCT GTA TTG CCT G TAAAAAAGAAAGAATTCCTGTGTCCTGTATGCCGCCGACTAGCCAATTCTGTATTGCCTG L--K--K--K--E--F--L--C--P--V--C--R--R--L--A--N--S--V--L--P-- AA TGT CCT GGA GAT TTA TGT TCT GTC TCA AAG CTA CAA GAT AGT CCA CGT ACT AAG TTA C AATGTCCTGGAGATTTATGTTCTGTCTCAAAGCTACAAGATAGTCCACGTACTAAGTTAC E--C--P--G--D--L--C--S--V--S--K--L--Q--D--S--P--R--T--K--L-- GT AGA AAA GAT GCA CTG CAG CCT TCT CTT TGG CTC TCT GAA GCG TTG TGT CTA CTA CGA T GTAGAAAAGATGCACTGCAGCCTTCTCTTTGGCTCTCTGAAGCGTTGTGTCTACTACGAT R--R--K--D--A--L--Q--P--S--L--W--L--S--E--A--L--C--L--L--R-- CT GCT GCT GAA GTG ATC GAA GAT GGT GAT AGA GGT AAA ACA GTT ACT CCA CAG GGA GAT G CTGCTGCTGAAGTGATCGAAGATGGTGATAGAGGTAAAACAGTTACTCCACAGGGAGATG S--A--A--E--V--I--E--D--G--D--R--G--K--T--V--T--P--Q--G--D-- GA CCA AGA AGG AAA GAT CTT AAA TCT GTC TCT AAA ATG CTC TGG GAT TTC TAT TTT CCC A GACCAAGAAGGAAAGATCTTAAATCTGTCTCTAAAATGCTCTGGGATTTCTATTTTCCCA G--P--R--R--K--D--L--K--S--V--S--K--M--L--W--D--F--Y--F--P-- AG CCA GAG GAT AAA ACT CTA AAA CGT CTG TGG CTA CCA CCA CAA TCA ATC GTC ATG TGG G 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AAG AAT ATA GAC C GTTCTTCGAGCAGCATATTTGGAAGTGAAGGCACAACAGGTTCATTGAAGAATATAGACC S--S--S--S--S--I--F--G--S--E--G--T--T--G--S--L--K--N--I--D-- TG CTC TGG AAT CGA GCA TCC GAT CCA GTT CTT GCC CAT GAC CCA TTT TCA TCA CTG ATG T TGCTCTGGAATCGAGCATCCGATCCAGTTCTTGCCCATGACCCATTTTCATCACTGATGT L--L--W--N--R--A--S--D--P--V--L--A--H--D--P--F--S--S--L--M-- GG GCT CTC TTT TGT CTT CCT TTT CCT TTT CTC ACG TGC GAG GAA TCT CTA TTG TCA CTT G GGGCTCTCTTTTGTCTTCCTTTTCCTTTTCTCACGTGCGAGGAATCTCTATTGTCACTTG W--A--L--F--C--L--P--F--P--F--L--T--C--E--E--S--L--L--S--L-- TG CAT ATT TTC CAC AGT GTC TCG CTT GTT CAG ACT GTA ATT GCT TAT TGT GCA TGT CGC C TGCATATTTTCCACAGTGTCTCGCTTGTTCAGACTGTAATTGCTTATTGTGCATGTCGCC V--H--I--F--H--S--V--S--L--V--Q--T--V--I--A--Y--C--A--C--R-- CA AGT GAA TTG AGT GAA TTA AAT TTT GGG GAA AAC CTG CTT AAT GAC ATC TCC AAC GCT T CAAGTGAATTGAGTGAATTAAATTTTGGGGAAAACCTGCTTAATGACATCTCCAACGCTT P--S--E--L--S--E--L--N--F--G--E--N--L--L--N--D--I--S--N--A-- TG AGA GAA TCA GGT GGT TGG GAG TAT TTC AGG TCG AAC AAT ATG GAT TTG TCA TGT GAT A TGAGAGAATCAGGTGGTTGGGAGTATTTCAGGTCGAACAATATGGATTTGTCATGTGATA L--R--E--S--G--G--W--E--Y--F--R--S--N--N--M--D--L--S--C--D-- TA AAA GAC ACA ATC CGT AAA TAT AGT CTT CCT TTC TTG AGG AGA TGT GCG TTG TTG TGG A TAAAAGACACAATCCGTAAATATAGTCTTCCTTTCTTGAGGAGATGTGCGTTGTTGTGGA I--K--D--T--I--R--K--Y--S--L--P--F--L--R--R--C--A--L--L--W-- AG CTA CTG AAA TCT ACT CCT AGG AAG CTT CAT GAA GAG TCA GAT ATG TTT GAT TTG CCA T AGCTACTGAAATCTACTCCTAGGAAGCTTCATGAAGAGTCAGATATGTTTGATTTGCCAT K--L--L--K--S--T--P--R--K--L--H--E--E--S--D--M--F--D--L--P-- CT GAC CCC ACC ACC GAC AAT ATG GAT TTC ATA TAC AGT CCC CAG TCT GAG CTG AAT CAT G CTGACCCCACCACCGACAATATGGATTTCATATACAGTCCCCAGTCTGAGCTGAATCATG S--D--P--T--T--D--N--M--D--F--I--Y--S--P--Q--S--E--L--N--H-- TG CAA GAA TTG GAG AAA ATG TTT AAC ATT CCA CCT ATA GAT ATC ATT CTT AAT GAT GAA C TGCAAGAATTGGAGAAAATGTTTAACATTCCACCTATAGATATCATTCTTAATGATGAAC V--Q--E--L--E--K--M--F--N--I--P--P--I--D--I--I--L--N--D--E-- TT CTC CGT TCT TCA ACC CAA ATA TGG CTC CAG CAT TTT CAG CGG GAA TAT AGA GTC AAC A TTCTCCGTTCTTCAACCCAAATATGGCTCCAGCATTTTCAGCGGGAATATAGAGTCAACA L--L--R--S--S--T--Q--I--W--L--Q--H--F--Q--R--E--Y--R--V--N-- GA GTT AAA AGG TCC CTT TGC ATC ACC CCT GTA GTT CCT TTC CAG CTA ATG AAA TTA CCC A GAGTTAAAAGGTCCCTTTGCATCACCCCTGTAGTTCCTTTCCAGCTAATGAAATTACCCA R--V--K--R--S--L--C--I--T--P--V--V--P--F--Q--L--M--K--L--P-- AT CTA TAC CAG GAC CTA CTA CAA AG G TGT ATA AAA AAA CGT TGC GTC AAC TGC ACC AAA G ATCTATACCAGGACCTACTACAAAGGTGTATAAAAAAACGTTGCGTCAACTGCACCAAAG N--L--Y--Q--D--L--L--Q--R--C--I--K--K--R--C--V--N--C--T--K-- TT ATC GAA GAA CCT GTA TTA TGT CTT CTG TGT GGA AGT TTG TGT TCT CCC ATA TGG AGC C TTATCGAAGAACCTGTATTATGTCTTCTGTGTGGAAGTTTGTGTTCTCCCATATGGAGCC V--I--E--E--P--V--L--C--L--L--C--G--S--L--C--S--P--I--W--S-- CT TGT TGC AG A GAA AGT GGT TGT CCT AAT CAT GCA ATT ACC TGT GGT GCT GGT ACT GGT G CTTGTTGCAGAGAAAGTGGTTGTCCTAATCATGCAATTACCTGTGGTGCTGGTACTGGTG P--C--C--R--E--S--G--C--P--N--H--A--I--T--C--G--A--G--T--G-- TA TTT CTT CTG ATA CGG CGG ACC ACA ATT TTG CTA CAA AGG TTT GCA AGA CAA TCA CCT T TATTTCTTCTGATACGGCGGACCACAATTTTGCTACAAAGGTTTGCAAGACAATCACCTT V--F--L--L--I--R--R--T--T--I--L--L--Q--R--F--A--R--Q--S--P-- GG CCA TCT CCT TAC CTG GAT ACG TTT GGA GAA GAG GAT ATC GAT ATG ATC AGA GGA AAA C GGCCATCTCCTTACCTGGATACGTTTGGAGAAGAGGATATCGATATGATCAGAGGAAAAC W--P--S--P--Y--L--D--T--F--G--E--E--D--I--D--M--I--R--G--K-- GA CTA TAC CTG AAT GAA GAA CGT TAT GCT GCT TTA ACT TAC TTG GTT GGT TCT CAT GGA C GACTATACCTGAATGAAGAACGTTATGCTGCTTTAACTTACTTGGTTGGTTCTCATGGAC R--L--Y--L--N--E--E--R--Y--A--A--L--T--Y--L--V--G--S--H--G-- TT GAT CGC AGT TCA AAA GTT CTC GGC CAA ACC ACA ATT GGA GCC GTC TTA CAT TAA ACGA TTGATCGCAGTTCAAAAGTTCTCGGCCAAACCACAATTGGAGCCGTCTTACATTAA.... L--D--R--S--S--K--V--L--G--Q--T--T--I--G--A--V--L--H--*-.... TCTGCGTGCTATTTCTCAGACATTGATCTCTATGAGATGGTATTCATATGTTGCTTTGAA ............................................................ ............................................................ ATCATCAGTTAAGATTCTAAAGATTTGAGAGCTTTTCTGATGATTTTTTTTTATTTGATT ............................................................ ............................................................ TCTGTCACTTTGGTTGATTTCTTTATTTGTGGATATATGCGATCATGTTTGTAAATAGAG ............................................................ ............................................................ TATTATTTCTTGGCAGTTGCATAATGTTTATTTTTAACAATACTATCATTGGTTAGTCTC ............................................................ ............................................................ TGTGCGCAGATTTGCATTGTTTCTTTTATTTTATTCAGGCTTACTACCTGAAAATGGTCG ............................................................ ............................................................ 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