Arabidopsis thaliana (TAIR10)
Description

cytosolic invertase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826535]

Location
About this transcript

This transcript has 6 exons, is annotated with 5 domains and features, is associated with 339 variant alleles and maps to 31 oligo probes.

Gene

This transcript is a product of gene AT4G09510 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
CINV2-201AT4G09510.12205558aa
 
Protein coding
Q67XD9 -Ensembl Canonical
CINV2-202AT4G09510.21977461aa
 
Protein coding
---
Codons
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  • Alternating codons
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     1 GATAAAATAAGTATCCCAAGCGAAAAGTCCAAAACCCAAAATCAGACCAGTAATATAACT     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 TGACCGTTTCTTAACCGGTAATTACCGGTTAACTCCGTCTCTTCCGTCGACATTTTTCCT    120
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   121 TACCAGACCCGTTTTGTTTTTGTCTTGTTTCGGTCTCTTAACAAGTCCCGTTTTGTATTC    180
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   181 TTCTTCCTTACTTCTTATTCTATCTATAAAACAACAACTTCACTCATCATGACTCTTTTT    240
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   241 CCCCATTTTCTTACTCTCTTGCCCTTTCTTCTCTCACTCTCCGGCGACTGTTACGAGTTT    300
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   301 TTAACACTTCCGTCGTCTTCTCAGTTGTTGTTGTTGTTTATGACAAGATCTTGTTCTATC    360
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   361 CATTAAAACCAAAGAAATGGAGGAAGGTCATAAAGAACCATTGGTGCTAAGAGTTGAAGG    420
       ................ATGGAGGAAGGTCATAAAGAACCATTGGTGCTAAGAGTTGAAGG     44
       ................-M--E--E--G--H--K--E--P--L--V--L--R--V--E--G     15

                                                                          
   421 ATCACATTGTTCTTTATCAGAGATGGATGATTTTGATCTAACTCGGGCTTTAGAGAAGCC    480
    45 ATCACATTGTTCTTTATCAGAGATGGATGATTTTGATCTAACTCGGGCTTTAGAGAAGCC    104
    15 --S--H--C--S--L--S--E--M--D--D--F--D--L--T--R--A--L--E--K--P     35

                                                                          
   481 GAGGCAGCTAAAGATCGAACGGAAGAGATCGTTTGACGAAAGGTCGATGAGCGAGTTATC    540
   105 GAGGCAGCTAAAGATCGAACGGAAGAGATCGTTTGACGAAAGGTCGATGAGCGAGTTATC    164
    35 --R--Q--L--K--I--E--R--K--R--S--F--D--E--R--S--M--S--E--L--S     55

                                                                          
   541 GACTGGCTATGTAAGACAAGATAGCATTTTAGAAATGGCTCATTCTCCTGGAAGTAGGTC    600
   165 GACTGGCTATGTAAGACAAGATAGCATTTTAGAAATGGCTCATTCTCCTGGAAGTAGGTC    224
    55 --T--G--Y--V--R--Q--D--S--I--L--E--M--A--H--S--P--G--S--R--S     75

                                                                          
   601 AATGGTGGACACTCCTCTCTCTGTTAGGAACTCTTTCGAGCCTCATCCGATGGTTGCTGA    660
   225 AATGGTGGACACTCCTCTCTCTGTTAGGAACTCTTTCGAGCCTCATCCGATGGTTGCTGA    284
    75 --M--V--D--T--P--L--S--V--R--N--S--F--E--P--H--P--M--V--A--E     95

                                                                          
   661 GGCTTGGGAAGCTTTGAGAAGGTCAATGGTGTTCTTTCGTGGTCAACCCGTTGGTACCAT    720
   285 GGCTTGGGAAGCTTTGAGAAGGTCAATGGTGTTCTTTCGTGGTCAACCCGTTGGTACCAT    344
    95 --A--W--E--A--L--R--R--S--M--V--F--F--R--G--Q--P--V--G--T--I    115

                                                                          
   721 TGCAGCTTATGACCATGCCTCCGAGGAGGTCTTGAACTATGATCAGGTGTTTGTACGTGA    780
   345 TGCAGCTTATGACCATGCCTCCGAGGAGGTCTTGAACTATGATCAGGTGTTTGTACGTGA    404
   115 --A--A--Y--D--H--A--S--E--E--V--L--N--Y--D--Q--V--F--V--R--D    135

                                                                          
   781 CTTTGTACCAAGTGCATTGGCGTTTCTGATGAATGGAGAGCCCGATATAGTGAAAAACTT    840
   405 CTTTGTACCAAGTGCATTGGCGTTTCTGATGAATGGAGAGCCCGATATAGTGAAAAACTT    464
   135 --F--V--P--S--A--L--A--F--L--M--N--G--E--P--D--I--V--K--N--F    155

                                                                          
   841 CTTGCTCAAGACACTTCAGCTTCAAGGTTGGGAGAAACGGGTTGACCGGTTCAAGCTTGG    900
   465 CTTGCTCAAGACACTTCAGCTTCAAGGTTGGGAGAAACGGGTTGACCGGTTCAAGCTTGG    524
   155 --L--L--K--T--L--Q--L--Q--G--W--E--K--R--V--D--R--F--K--L--G    175

                                                                          
   901 GGAAGGCGTTATGCCAGCGAGTTTCAAGGTGCTTCATGATCCAGTTCGTAAAACCGACAC    960
   525 GGAAGGCGTTATGCCAGCGAGTTTCAAGGTGCTTCATGATCCAGTTCGTAAAACCGACAC    584
   175 --E--G--V--M--P--A--S--F--K--V--L--H--D--P--V--R--K--T--D--T    195

                                                                          
   961 AATTATTGCGGATTTTGGAGAAAGCGCTATAGGAAGAGTAGCACCGGTGGATTCAGGATT   1020
   585 AATTATTGCGGATTTTGGAGAAAGCGCTATAGGAAGAGTAGCACCGGTGGATTCAGGATT    644
   195 --I--I--A--D--F--G--E--S--A--I--G--R--V--A--P--V--D--S--G--F    215

                                                                          
  1021 CTGGTGGATCATACTTCTCCGTGCTTACACGAAATCTACGGGAGATTTGACTTTATCTGA   1080
   645 CTGGTGGATCATACTTCTCCGTGCTTACACGAAATCTACGGGAGATTTGACTTTATCTGA    704
   215 --W--W--I--I--L--L--R--A--Y--T--K--S--T--G--D--L--T--L--S--E    235

                                                                          
  1081 GACACCAGAGTGTCAGAGGGGAATGAGGCTTATACTCTCTCTTTGCTTATCCGAAGGTTT   1140
   705 GACACCAGAGTGTCAGAGGGGAATGAGGCTTATACTCTCTCTTTGCTTATCCGAAGGTTT    764
   235 --T--P--E--C--Q--R--G--M--R--L--I--L--S--L--C--L--S--E--G--F    255

                                                                          
  1141 TGATACTTTCCCTACGCTTCTTTGTGCTGACGGTTGTTCTATGGTTGATAGGAGAATGGG   1200
   765 TGATACTTTCCCTACGCTTCTTTGTGCTGACGGTTGTTCTATGGTTGATAGGAGAATGGG    824
   255 --D--T--F--P--T--L--L--C--A--D--G--C--S--M--V--D--R--R--M--G    275

                                                                          
  1201 TGTTTATGGATATCCAATAGAGATTCAAGCTCTGTTTTTCATGGCATTGAGATGCGCCTT   1260
   825 TGTTTATGGATATCCAATAGAGATTCAAGCTCTGTTTTTCATGGCATTGAGATGCGCCTT    884
   275 --V--Y--G--Y--P--I--E--I--Q--A--L--F--F--M--A--L--R--C--A--L    295

                                                                          
  1261 GTCGATGCTTAAACCAGACGAGGAAGGTCGAGATTTCATAGAAAGGATTGTGAAGAGACT   1320
   885 GTCGATGCTTAAACCAGACGAGGAAGGTCGAGATTTCATAGAAAGGATTGTGAAGAGACT    944
   295 --S--M--L--K--P--D--E--E--G--R--D--F--I--E--R--I--V--K--R--L    315

                                                                          
  1321 TCACGCGCTGAGTTTCCATATGCGCAGTTACTTTTGGCTTGACTTTCAACAACTCAACGA   1380
   945 TCACGCGCTGAGTTTCCATATGCGCAGTTACTTTTGGCTTGACTTTCAACAACTCAACGA   1004
   315 --H--A--L--S--F--H--M--R--S--Y--F--W--L--D--F--Q--Q--L--N--D    335

                                                                          
  1381 TATCTATAGGTACAAGACAGAGGAGTACTCACACACCGCGGTGAACAAGTTCAACGTGAT   1440
  1005 TATCTATAGGTACAAGACAGAGGAGTACTCACACACCGCGGTGAACAAGTTCAACGTGAT   1064
   335 --I--Y--R--Y--K--T--E--E--Y--S--H--T--A--V--N--K--F--N--V--M    355

                                                                          
  1441 GCCGGACTCGATACCAGACTGGGTTTTCGACTTTATGCCTCTCCGTGGAGGATATTTTGT   1500
  1065 GCCGGACTCGATACCAGACTGGGTTTTCGACTTTATGCCTCTCCGTGGAGGATATTTTGT   1124
   355 --P--D--S--I--P--D--W--V--F--D--F--M--P--L--R--G--G--Y--F--V    375

                                                                          
  1501 CGGCAATGTAAGCCCGGCCCGTATGGATTTCAGGTGGTTTTCCTTAGGAAATTGTGTCTC   1560
  1125 CGGCAATGTAAGCCCGGCCCGTATGGATTTCAGGTGGTTTTCCTTAGGAAATTGTGTCTC   1184
   375 --G--N--V--S--P--A--R--M--D--F--R--W--F--S--L--G--N--C--V--S    395

                                                                          
  1561 CATCCTTTCTTCCTTGGCAACTCCGGATCAGTCAATGGCTATTATGGACCTCCTCGAGCA   1620
  1185 CATCCTTTCTTCCTTGGCAACTCCGGATCAGTCAATGGCTATTATGGACCTCCTCGAGCA   1244
   395 --I--L--S--S--L--A--T--P--D--Q--S--M--A--I--M--D--L--L--E--H    415

                                                                          
  1621 CCGTTGGGAGGAGCTAGTAGGCGAGATGCCGCTCAAGATATGTTACCCTTGCATCGAAAG   1680
  1245 CCGTTGGGAGGAGCTAGTAGGCGAGATGCCGCTCAAGATATGTTACCCTTGCATCGAAAG   1304
   415 --R--W--E--E--L--V--G--E--M--P--L--K--I--C--Y--P--C--I--E--S    435

                                                                          
  1681 CCACGAGTGGCGGATTGTTACCGGTTGTGATCCTAAAAACACGAGGTGGAGTTACCACAA   1740
  1305 CCACGAGTGGCGGATTGTTACCGGTTGTGATCCTAAAAACACGAGGTGGAGTTACCACAA   1364
   435 --H--E--W--R--I--V--T--G--C--D--P--K--N--T--R--W--S--Y--H--N    455

                                                                          
  1741 CGGTGGATCTTGGCCAGTATTGCTGTGGACGCTGACGGCGGCATGCATCAAGACTGGACG   1800
  1365 CGGTGGATCTTGGCCAGTATTGCTGTGGACGCTGACGGCGGCATGCATCAAGACTGGACG   1424
   455 --G--G--S--W--P--V--L--L--W--T--L--T--A--A--C--I--K--T--G--R    475

                                                                          
  1801 GCCTCAAATAGCGAGACGTGCGATTGATCTAATTGAATCACGGCTACACCGAGATTGCTG   1860
  1425 GCCTCAAATAGCGAGACGTGCGATTGATCTAATTGAATCACGGCTACACCGAGATTGCTG   1484
   475 --P--Q--I--A--R--R--A--I--D--L--I--E--S--R--L--H--R--D--C--W    495

                                                                          
  1861 GCCGGAATACTATGATGGTAAGCAAGGAAGGTACGTTGGAAAACAAGCAAGGAAGTACCA   1920
  1485 GCCGGAATACTATGATGGTAAGCAAGGAAGGTACGTTGGAAAACAAGCAAGGAAGTACCA   1544
   495 --P--E--Y--Y--D--G--K--Q--G--R--Y--V--G--K--Q--A--R--K--Y--Q    515

                                                                          
  1921 GACTTGGTCAATCGCGGGTTACTTGGTTGCGAAAATGATGCTTGAAGATCCTTCACATAT   1980
  1545 GACTTGGTCAATCGCGGGTTACTTGGTTGCGAAAATGATGCTTGAAGATCCTTCACATAT   1604
   515 --T--W--S--I--A--G--Y--L--V--A--K--M--M--L--E--D--P--S--H--I    535

                                                                          
  1981 TGGAATGATCTCTCTTGAAGAAGACAAACAGATGAAACCTGTTATCAAGAGATCTGCTTC   2040
  1605 TGGAATGATCTCTCTTGAAGAAGACAAACAGATGAAACCTGTTATCAAGAGATCTGCTTC   1664
   535 --G--M--I--S--L--E--E--D--K--Q--M--K--P--V--I--K--R--S--A--S    555

                                                                          
  2041 ATGGACTTGCTGAATTTTGTTTCTTGTTTTGTATTATAATGTCATTTGATTAAGCATTCA   2100
  1665 ATGGACTTGCTGA...............................................   1677
   555 --W--T--C--*-...............................................    558

                                                                          
  2101 AAAGACCTTTAATCAGCGAGAGAGTAGTTCTGTTTGTATTTCTCTTTGATCCAACTATGG   2160
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2161 TTTATTTTCACTTGAGGCATAATATAATCTCTTCCTAGATCAACA                  2205
       .............................................                      
       .............................................