Transcript: AT4G09510.1 CINV2-201
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Description
cytosolic invertase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826535 ]
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CINV2-201 AT4G09510.1 2205 558aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
Q67XD9 - A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical, CINV2-202 AT4G09510.2 1977 461aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 G ATAAAATAAGTATCCCAAGCGAAAAGTCCAAAACCCAAAATCAGACCAGTAATATAACT 60
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61 TGACCGTTTCTTAACCGGTAATTACCGGTTAACTCCGTCTCTTCCGTCGACATTTTTCCT 120
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121 TACCAGACCCGTTTTGTTTTTGTCTTGTTTCGGTCTCTTAACAAGTCCCGTTTTGTATTC 180
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181 TTCTTCCTTACTTCTTATTCTATCTATAAAACAACAACTTCACTCATCATGACTCTTTTT 240
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241 CCCCATTTTCTTACTCTCTTGCCCTTTCTTCTCTCACTCTCCGGCGACTGTTACGAGTTT 300
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301 TTAACACTTCCGTCGTCTTCTCAG TTGTTGTTGTTGTTTATGACAAGATCTTGTTCTATC 360
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361 CATTAAAACCAAAGAA ATG GAG GAA GGT CAT AAA GAA CCA TTG GTG CTA AGA GTT GAA GG 420
................ATGGAGGAAGGTCATAAAGAACCATTGGTGCTAAGAGTTGAAGG 44
................-M--E--E--G--H--K--E--P--L--V--L--R--V--E--G 15
421 A TCA CAT TGT TCT TTA TCA GAG ATG GAT GAT TTT GAT CTA ACT CGG GCT TTA GAG AAG CC 480
45 ATCACATTGTTCTTTATCAGAGATGGATGATTTTGATCTAACTCGGGCTTTAGAGAAGCC 104
15 --S--H--C--S--L--S--E--M--D--D--F--D--L--T--R--A--L--E--K--P 35
481 G AGG CAG CTA AAG ATC GAA CGG AAG AGA TCG TTT GAC GAA AGG TCG ATG AGC GAG TTA TC 540
105 GAGGCAGCTAAAGATCGAACGGAAGAGATCGTTTGACGAAAGGTCGATGAGCGAGTTATC 164
35 --R--Q--L--K--I--E--R--K--R--S--F--D--E--R--S--M--S--E--L--S 55
541 G ACT GGC TAT GTA AGA CAA GAT AGC ATT TTA GAA ATG GCT CAT TCT CCT GGA AGT AGG TC 600
165 GACTGGCTATGTAAGACAAGATAGCATTTTAGAAATGGCTCATTCTCCTGGAAGTAGGTC 224
55 --T--G--Y--V--R--Q--D--S--I--L--E--M--A--H--S--P--G--S--R--S 75
601 A ATG GTG GAC ACT CCT CTC TCT GTT AGG AAC TCT TTC GAG CCT CAT CCG ATG GTT GCT GA 660
225 AATGGTGGACACTCCTCTCTCTGTTAGGAACTCTTTCGAGCCTCATCCGATGGTTGCTGA 284
75 --M--V--D--T--P--L--S--V--R--N--S--F--E--P--H--P--M--V--A--E 95
661 G GCT TGG GAA GCT TTG AGA AGG TCA ATG GTG TTC TTT CGT GGT CAA CCC GTT GGT ACC AT 720
285 GGCTTGGGAAGCTTTGAGAAGGTCAATGGTGTTCTTTCGTGGTCAACCCGTTGGTACCAT 344
95 --A--W--E--A--L--R--R--S--M--V--F--F--R--G--Q--P--V--G--T--I 115
721 T GCA GCT TAT GAC CAT GCC TCC GAG GAG GTC TTG AAC TAT GAT CAG GTG TTT GTA CGT GA 780
345 TGCAGCTTATGACCATGCCTCCGAGGAGGTCTTGAACTATGATCAGGTGTTTGTACGTGA 404
115 --A--A--Y--D--H--A--S--E--E--V--L--N--Y--D--Q--V--F--V--R--D 135
781 C TTT GTA CCA AGT GCA TTG GCG TTT CTG ATG AAT GGA GAG CCC GAT ATA GTG AAA AAC TT 840
405 CTTTGTACCAAGTGCATTGGCGTTTCTGATGAATGGAGAGCCCGATATAGTGAAAAACTT 464
135 --F--V--P--S--A--L--A--F--L--M--N--G--E--P--D--I--V--K--N--F 155
841 C TTG CTC AAG ACA CTT CAG CTT CAA GGT TGG GAG AAA CGG GTT GAC CGG TTC AAG CTT GG 900
465 CTTGCTCAAGACACTTCAGCTTCAAGGTTGGGAGAAACGGGTTGACCGGTTCAAGCTTGG 524
155 --L--L--K--T--L--Q--L--Q--G--W--E--K--R--V--D--R--F--K--L--G 175
901 G GAA GGC GTT ATG CCA GCG AGT TTC AAG GTG CTT CAT GAT CCA GTT CGT AAA ACC GAC AC 960
525 GGAAGGCGTTATGCCAGCGAGTTTCAAGGTGCTTCATGATCCAGTTCGTAAAACCGACAC 584
175 --E--G--V--M--P--A--S--F--K--V--L--H--D--P--V--R--K--T--D--T 195
961 A ATT ATT GCG GAT TTT GGA GAA AGC GCT ATA GGA AGA GTA GCA CCG GTG GAT TCA GGA TT 1020
585 AATTATTGCGGATTTTGGAGAAAGCGCTATAGGAAGAGTAGCACCGGTGGATTCAGGATT 644
195 --I--I--A--D--F--G--E--S--A--I--G--R--V--A--P--V--D--S--G--F 215
1021 C TGG TGG ATC ATA CTT CTC CGT GCT TAC ACG AAA TCT ACG GGA GAT TTG ACT TTA TCT GA 1080
645 CTGGTGGATCATACTTCTCCGTGCTTACACGAAATCTACGGGAGATTTGACTTTATCTGA 704
215 --W--W--I--I--L--L--R--A--Y--T--K--S--T--G--D--L--T--L--S--E 235
1081 G ACA CCA GAG TGT CAG AGG GGA ATG AGG CTT ATA CTC TCT CTT TGC TTA TCC GAA GGT TT 1140
705 GACACCAGAGTGTCAGAGGGGAATGAGGCTTATACTCTCTCTTTGCTTATCCGAAGGTTT 764
235 --T--P--E--C--Q--R--G--M--R--L--I--L--S--L--C--L--S--E--G--F 255
1141 T GAT ACT TTC CCT ACG CTT CTT TGT GCT GAC GGT TGT TCT ATG GTT GAT AGG AGA ATG G G 1200
765 TGATACTTTCCCTACGCTTCTTTGTGCTGACGGTTGTTCTATGGTTGATAGGAGAATGGG 824
255 --D--T--F--P--T--L--L--C--A--D--G--C--S--M--V--D--R--R--M--G 275
1201 T GTT TAT GGA TAT CCA ATA GAG ATT CAA GCT CTG TTT TTC ATG GCA TTG AGA TGC GCC TT 1260
825 TGTTTATGGATATCCAATAGAGATTCAAGCTCTGTTTTTCATGGCATTGAGATGCGCCTT 884
275 --V--Y--G--Y--P--I--E--I--Q--A--L--F--F--M--A--L--R--C--A--L 295
1261 G TCG ATG CTT AAA CCA GAC GAG GAA GGT CGA GAT TTC ATA GAA AGG ATT GTG AAG AGA CT 1320
885 GTCGATGCTTAAACCAGACGAGGAAGGTCGAGATTTCATAGAAAGGATTGTGAAGAGACT 944
295 --S--M--L--K--P--D--E--E--G--R--D--F--I--E--R--I--V--K--R--L 315
1321 T CAC GCG CTG AGT TTC CAT ATG CGC AGT TAC TTT TGG CTT GAC TTT CAA CAA CTC AAC GA 1380
945 TCACGCGCTGAGTTTCCATATGCGCAGTTACTTTTGGCTTGACTTTCAACAACTCAACGA 1004
315 --H--A--L--S--F--H--M--R--S--Y--F--W--L--D--F--Q--Q--L--N--D 335
1381 T ATC TAT AG G TAC AAG ACA GAG GAG TAC TCA CAC ACC GCG GTG AAC AAG TTC AAC GTG AT 1440
1005 TATCTATAGGTACAAGACAGAGGAGTACTCACACACCGCGGTGAACAAGTTCAACGTGAT 1064
335 --I--Y--R--Y--K--T--E--E--Y--S--H--T--A--V--N--K--F--N--V--M 355
1441 G CCG GAC TCG ATA CCA GAC TGG GTT TTC GAC TTT ATG CCT CTC CGT GGA GGA TAT TTT GT 1500
1065 GCCGGACTCGATACCAGACTGGGTTTTCGACTTTATGCCTCTCCGTGGAGGATATTTTGT 1124
355 --P--D--S--I--P--D--W--V--F--D--F--M--P--L--R--G--G--Y--F--V 375
1501 C GGC AAT GTA AGC CCG GCC CGT ATG GAT TTC AGG TGG TTT TCC TTA GGA AAT TGT GTC TC 1560
1125 CGGCAATGTAAGCCCGGCCCGTATGGATTTCAGGTGGTTTTCCTTAGGAAATTGTGTCTC 1184
375 --G--N--V--S--P--A--R--M--D--F--R--W--F--S--L--G--N--C--V--S 395
1561 C ATC CTT TCT TCC TTG GCA ACT CCG GAT CAG TCA ATG GCT ATT ATG GAC CTC CTC GAG CA 1620
1185 CATCCTTTCTTCCTTGGCAACTCCGGATCAGTCAATGGCTATTATGGACCTCCTCGAGCA 1244
395 --I--L--S--S--L--A--T--P--D--Q--S--M--A--I--M--D--L--L--E--H 415
1621 C CGT TGG GAG GAG CTA GTA GGC GAG ATG CCG CTC AAG ATA TGT TAC CCT TGC ATC GAA AG 1680
1245 CCGTTGGGAGGAGCTAGTAGGCGAGATGCCGCTCAAGATATGTTACCCTTGCATCGAAAG 1304
415 --R--W--E--E--L--V--G--E--M--P--L--K--I--C--Y--P--C--I--E--S 435
1681 C CAC GAG TGG CGG ATT GTT ACC GGT TGT GAT CCT AAA AAC ACG AGG TGG AGT TAC CAC AA 1740
1305 CCACGAGTGGCGGATTGTTACCGGTTGTGATCCTAAAAACACGAGGTGGAGTTACCACAA 1364
435 --H--E--W--R--I--V--T--G--C--D--P--K--N--T--R--W--S--Y--H--N 455
1741 C GGT GGA TCT TGG CCA G T A TTG CTG TGG ACG CTG ACG GCG GCA TGC ATC AAG ACT GGA CG 1800
1365 CGGTGGATCTTGGCCAGTATTGCTGTGGACGCTGACGGCGGCATGCATCAAGACTGGACG 1424
455 --G--G--S--W--P--V--L--L--W--T--L--T--A--A--C--I--K--T--G--R 475
1801 G CCT CAA ATA GCG AGA CGT GCG ATT GAT CTA ATT GAA TCA CGG CTA CAC CGA GAT TGC TG 1860
1425 GCCTCAAATAGCGAGACGTGCGATTGATCTAATTGAATCACGGCTACACCGAGATTGCTG 1484
475 --P--Q--I--A--R--R--A--I--D--L--I--E--S--R--L--H--R--D--C--W 495
1861 G CCG GAA TAC TAT GAT GGT AAG CAA GGA AGG TAC GTT GGA AAA CAA GCA AGG AAG TAC CA 1920
1485 GCCGGAATACTATGATGGTAAGCAAGGAAGGTACGTTGGAAAACAAGCAAGGAAGTACCA 1544
495 --P--E--Y--Y--D--G--K--Q--G--R--Y--V--G--K--Q--A--R--K--Y--Q 515
1921 G ACT TGG TCA ATC GCG GGT TAC TTG GTT GCG AAA ATG ATG CTT GAA GAT CCT TCA CAT AT 1980
1545 GACTTGGTCAATCGCGGGTTACTTGGTTGCGAAAATGATGCTTGAAGATCCTTCACATAT 1604
515 --T--W--S--I--A--G--Y--L--V--A--K--M--M--L--E--D--P--S--H--I 535
1981 T GGA ATG ATC TCT CTT GAA GAA GAC AAA CAG ATG AAA CCT GTT ATC AAG AGA TCT GCT TC 2040
1605 TGGAATGATCTCTCTTGAAGAAGACAAACAGATGAAACCTGTTATCAAGAGATCTGCTTC 1664
535 --G--M--I--S--L--E--E--D--K--Q--M--K--P--V--I--K--R--S--A--S 555
2041 A TGG ACT TGC TGA ATTTTGTTTCTTGTTTTGTATTATAATGTCATTTGATTAAGCATTCA 2100
1665 ATGGACTTGCTGA............................................... 1677
555 --W--T--C--*-............................................... 558
2101 AAAGACCTTTAATCAGCGAGAGAGTAGTTCTGTTTGTATTTCTCTTTGATCCAACTATGG 2160
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2161 TTTATTTTCACTTGAGGCATAATATAATCTCTTCCTAGATCAACA 2205
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