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Arabidopsis thaliana (TAIR10)
Description

RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816443]

Location
About this transcript

This transcript has 7 exons, is annotated with 16 domains and features, is associated with 434 variant alleles and maps to 31 oligo probes.

Gene

This transcript is a product of gene AT2G19260 Show transcript tableHide transcript table

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  • Name
  • Transcript ID
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
AT2G19260-202AT2G19260.22648631aa
 
Protein coding
F4ISG1 -Ensembl Canonical
AT2G19260-201AT2G19260.12514631aa
 
Protein coding
F4ISG1 --
Variants
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Markup
  • loaded
                                                                          
     1 TTTTGAAGTTATATATATAAATTTTTCCACAGGAAAATCAAAGAAAGTTGTTTTGCCAGT     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 GAGTTAGAGAGAGAGAGAGCGATAGAGCGAGAGAGAGAGAGAGCTTGCGTCAGTGGAGGA    120
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   121 GTCGGAAACTTGAGAAACTTGTTTAGAAGAAACGCCATAACTTGGAGAAGCCCAAACGAG    180
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   181 GATTTTGCTCTTGTGTATCTTCGTAGTCCATCTGGTGATCAGAAGGATATGAGCATTACC    240
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   241 ATTCCAGAGGGACTACATGAAGAAGTCGACCAACAGATTCATTGGTACTTAGAGAAGTAA    300
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   301 TGTGCTTTCAGATACTTTTTTGGTTTCTCAGGAAAACATGTTGGTGGAAAGTTCGTTCAG    360
       .....................................ATGTTGGTGGAAAGTTCGTTCAG     23
       .....................................-M--L--V--E--S--S--F--S      8

                                                                          
   361 CTCTTCTGTTGAAACTAGTCTACTGAACGTATCCGAGTATCAAGACCCATTTGCTGCATA    420
    24 CTCTTCTGTTGAAACTAGTCTACTGAACGTATCCGAGTATCAAGACCCATTTGCTGCATA     83
     8 --S--S--V--E--T--S--L--L--N--V--S--E--Y--Q--D--P--F--A--A--Y     28

                                                                          
   421 TGATTGGACGTCTCTTGCTGAATCTTATCAGATGATCCACAAAGTTCCCGAACAGTCTCA    480
    84 TGATTGGACGTCTCTTGCTGAATCTTATCAGATGATCCACAAAGTTCCCGAACAGTCTCA    143
    28 --D--W--T--S--L--A--E--S--Y--Q--M--I--H--K--V--P--E--Q--S--Q     48

                                                                          
   481 AGTAAGCTTTCTTAAAAATGTTCCAGTCACTGATACTATGAATCTTGATGAATCAAAACA    540
   144 AGTAAGCTTTCTTAAAAATGTTCCAGTCACTGATACTATGAATCTTGATGAATCAAAACA    203
    48 --V--S--F--L--K--N--V--P--V--T--D--T--M--N--L--D--E--S--K--H     68

                                                                          
   541 TCCAAAACATCAAGAAAGTTGTTCAGAGAAATCTGTTATGCATAAGGTATCGGGAAAGGC    600
   204 TCCAAAACATCAAGAAAGTTGTTCAGAGAAATCTGTTATGCATAAGGTATCGGGAAAGGC    263
    68 --P--K--H--Q--E--S--C--S--E--K--S--V--M--H--K--V--S--G--K--A     88

                                                                          
   601 TCTGACTTCTCTTGTGTATCGTCGAAGGAAGAGGACCTTAATACCTGGGGGAACTGAGGA    660
   264 TCTGACTTCTCTTGTGTATCGTCGAAGGAAGAGGACCTTAATACCTGGGGGAACTGAGGA    323
    88 --L--T--S--L--V--Y--R--R--R--K--R--T--L--I--P--G--G--T--E--E    108

                                                                          
   661 ACATAACCTAGGAAAAATCAGGAAACAGGATGATTCTCTTGATGACTCTATTGTCTCTTT    720
   324 ACATAACCTAGGAAAAATCAGGAAACAGGATGATTCTCTTGATGACTCTATTGTCTCTTT    383
   108 --H--N--L--G--K--I--R--K--Q--D--D--S--L--D--D--S--I--V--S--L    128

                                                                          
   721 ATATAACCCTGAAGAAAGCACAAAAAGGAAAAATCGCTTCAACAACTGTCTTGTCTATAG    780
   384 ATATAACCCTGAAGAAAGCACAAAAAGGAAAAATCGCTTCAACAACTGTCTTGTCTATAG    443
   128 --Y--N--P--E--E--S--T--K--R--K--N--R--F--N--N--C--L--V--Y--S    148

                                                                          
   781 CCGGAAAAAAAGGAGAGGGGAATCCAGTTGTACTTTTACTGGAGAAACTACGATAAGGGG    840
   444 CCGGAAAAAAAGGAGAGGGGAATCCAGTTGTACTTTTACTGGAGAAACTACGATAAGGGG    503
   148 --R--K--K--R--R--G--E--S--S--C--T--F--T--G--E--T--T--I--R--G    168

                                                                          
   841 TGATGGGCTTGATGATGCTTTTGTTTCTGAGCATGACTGTGGAGAAACCAGGAGAAGAGG    900
   504 TGATGGGCTTGATGATGCTTTTGTTTCTGAGCATGACTGTGGAGAAACCAGGAGAAGAGG    563
   168 --D--G--L--D--D--A--F--V--S--E--H--D--C--G--E--T--R--R--R--G    188

                                                                          
   901 CAATCGATCAGATGATTGCCTTGTGTATAGCAGGAAGAAAGGTAGAGTGAAATTTAATAG    960
   564 CAATCGATCAGATGATTGCCTTGTGTATAGCAGGAAGAAAGGTAGAGTGAAATTTAATAG    623
   188 --N--R--S--D--D--C--L--V--Y--S--R--K--K--G--R--V--K--F--N--S    208

                                                                          
   961 TTGTAGTTTTAGCAAACATGTCACTGGACGAACCAAGATAAGCTATGATCAAGCTGACTC   1020
   624 TTGTAGTTTTAGCAAACATGTCACTGGACGAACCAAGATAAGCTATGATCAAGCTGACTC    683
   208 --C--S--F--S--K--H--V--T--G--R--T--K--I--S--Y--D--Q--A--D--S    228

                                                                          
  1021 TTCTGCATGTAGCCAAATGGGACAGATAGTTAAAGCTGATAGTTCTTTAACTAGACCTAA   1080
   684 TTCTGCATGTAGCCAAATGGGACAGATAGTTAAAGCTGATAGTTCTTTAACTAGACCTAA    743
   228 --S--A--C--S--Q--M--G--Q--I--V--K--A--D--S--S--L--T--R--P--K    248

                                                                          
  1081 GCCTGGAGAAATCAAGAAAAGTGGTCATCAACTTGTTTACAGCCAAAGAAAGCAGTTAGT   1140
   744 GCCTGGAGAAATCAAGAAAAGTGGTCATCAACTTGTTTACAGCCAAAGAAAGCAGTTAGT    803
   248 --P--G--E--I--K--K--S--G--H--Q--L--V--Y--S--Q--R--K--Q--L--V    268

                                                                          
  1141 GAAATCTAATGGGAGCTTTACTGAAAGTCATGTTGGAAAAACCAAGAGAAATGGAGATAG   1200
   804 GAAATCTAATGGGAGCTTTACTGAAAGTCATGTTGGAAAAACCAAGAGAAATGGAGATAG    863
   268 --K--S--N--G--S--F--T--E--S--H--V--G--K--T--K--R--N--G--D--R    288

                                                                          
  1201 ATCTGAGGTCTTACTTACGTATAGCCGGAGGAAGAAGAGTGGGAAATCTATTGGTGTTCG   1260
   864 ATCTGAGGTCTTACTTACGTATAGCCGGAGGAAGAAGAGTGGGAAATCTATTGGTGTTCG    923
   288 --S--E--V--L--L--T--Y--S--R--R--K--K--S--G--K--S--I--G--V--R    308

                                                                          
  1261 GGTTAATGGCTTTCTAGTTTATACCCGGAAGAAGTTAAAATTCAGAGGACCTTTTGCTAG   1320
   924 GGTTAATGGCTTTCTAGTTTATACCCGGAAGAAGTTAAAATTCAGAGGACCTTTTGCTAG    983
   308 --V--N--G--F--L--V--Y--T--R--K--K--L--K--F--R--G--P--F--A--R    328

                                                                          
  1321 ACGTGACCTAAGCGAAACCAAGAAAAATGGTGATCAACGTTCTACTGTCAGTTCTCGAGA   1380
   984 ACGTGACCTAAGCGAAACCAAGAAAAATGGTGATCAACGTTCTACTGTCAGTTCTCGAGA   1043
   328 --R--D--L--S--E--T--K--K--N--G--D--Q--R--S--T--V--S--S--R--E    348

                                                                          
  1381 ACTTTTAGACGATACCCAAGTTACCGAAGTGACATGTTCTTCTGATGGAACAAATGACAG   1440
  1044 ACTTTTAGACGATACCCAAGTTACCGAAGTGACATGTTCTTCTGATGGAACAAATGACAG   1103
   348 --L--L--D--D--T--Q--V--T--E--V--T--C--S--S--D--G--T--N--D--S    368

                                                                          
  1441 CTGCTCCTCATTGAAATCCAGTTCTGAAGTTAATTCAACTTCTAGTAAATCTCGGGAAGA   1500
  1104 CTGCTCCTCATTGAAATCCAGTTCTGAAGTTAATTCAACTTCTAGTAAATCTCGGGAAGA   1163
   368 --C--S--S--L--K--S--S--S--E--V--N--S--T--S--S--K--S--R--E--D    388

                                                                          
  1501 TGATTGCTATTCCTCTGATTCTGGGGTGTCTGAGACAGATACAGATGGTAGTAGCAGCCC   1560
  1164 TGATTGCTATTCCTCTGATTCTGGGGTGTCTGAGACAGATACAGATGGTAGTAGCAGCCC   1223
   388 --D--C--Y--S--S--D--S--G--V--S--E--T--D--T--D--G--S--S--S--P    408

                                                                          
  1561 TTTCAGGCAGTGTAAACATTGTGATAAGCCAGGAACTGTCGAAAAGATGCTAATTTGTGA   1620
  1224 TTTCAGGCAGTGTAAACATTGTGATAAGCCAGGAACTGTCGAAAAGATGCTAATTTGTGA   1283
   408 --F--R--Q--C--K--H--C--D--K--P--G--T--V--E--K--M--L--I--C--D    428

                                                                          
  1621 TGAATGTGAAGAAGCATATCATACACGCTGCTGCGGTGTTCAAATGAAAGACGTTGCAGA   1680
  1284 TGAATGTGAAGAAGCATATCATACACGCTGCTGCGGTGTTCAAATGAAAGACGTTGCAGA   1343
   428 --E--C--E--E--A--Y--H--T--R--C--C--G--V--Q--M--K--D--V--A--E    448

                                                                          
  1681 GATAGATGAGTGGCTCTGTCCATCCTGTTTGAAAAATCAGTCATCAAAGACCAAGACTAA   1740
  1344 GATAGATGAGTGGCTCTGTCCATCCTGTTTGAAAAATCAGTCATCAAAGACCAAGACTAA   1403
   448 --I--D--E--W--L--C--P--S--C--L--K--N--Q--S--S--K--T--K--T--K    468

                                                                          
  1741 GGGGAGAATTTCACATGAACGGAAATGGAGAGTTACAGTACCATTTGTAATAGGAATTAG   1800
  1404 GGGGAGAATTTCACATGAACGGAAATGGAGAGTTACAGTACCATTTGTAATAGGAATTAG   1463
   468 --G--R--I--S--H--E--R--K--W--R--V--T--V--P--F--V--I--G--I--R    488

                                                                          
  1801 AATAGGAAAAATGTTTCAAGCAGATGTTCCAGACTGGTCAGGTCCAACAATGAGTGATAC   1860
  1464 AATAGGAAAAATGTTTCAAGCAGATGTTCCAGACTGGTCAGGTCCAACAATGAGTGATAC   1523
   488 --I--G--K--M--F--Q--A--D--V--P--D--W--S--G--P--T--M--S--D--T    508

                                                                          
  1861 TTCTTTTGTGGGTGAACCATTGGAAATTGGCCAGTCAGAATACATGCATGATCTCAAGAA   1920
  1524 TTCTTTTGTGGGTGAACCATTGGAAATTGGCCAGTCAGAATACATGCATGATCTCAAGAA   1583
   508 --S--F--V--G--E--P--L--E--I--G--Q--S--E--Y--M--H--D--L--K--K    528

                                                                          
  1921 GGCCAAGAATAGTAAGAAACAATGTTCTGCAGTGAATTGGCTTCAATGCAGAGAAGAAGA   1980
  1584 GGCCAAGAATAGTAAGAAACAATGTTCTGCAGTGAATTGGCTTCAATGCAGAGAAGAAGA   1643
   528 --A--K--N--S--K--K--Q--C--S--A--V--N--W--L--Q--C--R--E--E--D    548

                                                                          
  1981 TACTAATGGAGTTATCTGCGGAAAGTGGCGTAGGGCCCCTCGTTCAGAGGTACAAACCAA   2040
  1644 TACTAATGGAGTTATCTGCGGAAAGTGGCGTAGGGCCCCTCGTTCAGAGGTACAAACCAA   1703
   548 --T--N--G--V--I--C--G--K--W--R--R--A--P--R--S--E--V--Q--T--K    568

                                                                          
  2041 AGACTGGGAATGCTTCTGCTGCTTCTCTTGGGATCCATCACGTGCTGACTGTGCCGTCCC   2100
  1704 AGACTGGGAATGCTTCTGCTGCTTCTCTTGGGATCCATCACGTGCTGACTGTGCCGTCCC   1763
   568 --D--W--E--C--F--C--C--F--S--W--D--P--S--R--A--D--C--A--V--P    588

                                                                          
  2101 TCAGGAACTGGAGACAAGTGAGATCCTTAAACAACTCAAGTACATCAAGATGCTTAGACC   2160
  1764 TCAGGAACTGGAGACAAGTGAGATCCTTAAACAACTCAAGTACATCAAGATGCTTAGACC   1823
   588 --Q--E--L--E--T--S--E--I--L--K--Q--L--K--Y--I--K--M--L--R--P    608

                                                                          
  2161 TCGATCAGACGCCAAAAAGCGAAAACTAGGACCAAAGGGTCGAAGCAGATCACATATCAA   2220
  1824 TCGATCAGACGCCAAAAAGCGAAAACTAGGACCAAAGGGTCGAAGCAGATCACATATCAA   1883
   608 --R--S--D--A--K--K--R--K--L--G--P--K--G--R--S--R--S--H--I--K    628

                                                                          
  2221 AGGAAAATCTTGATGGACACAATCAAAATGCATATGCTTTTGGATTAGAGAGACCTTAGA   2280
  1884 AGGAAAATCTTGA...............................................   1896
   628 --G--K--S--*-...............................................    631

                                                                          
  2281 AACTAGAAAGGTAACATCAGAAATTTTTTGTGAAGCGCCAATGCTTTTTGTACTACTTGA   2340
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2341 GGATATCAAGTTGCTTTCTAAGTGACTAATTAGGTTCAGATCTTTTGTTAGCTCCCAAAA   2400
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       ............................................................       

                                                                          
  2401 CAGGAGTAGTGAATAGAACGTTTGTGTTAAGGGACAGGTTCTGGGTTAAATGTGAGATTC   2460
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       ............................................................       

                                                                          
  2461 ATCTTGAATGCAACAAAATCTATAATCAGCTTCCGGGTCAAAGCATTCTGCTGA         2514
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