Arabidopsis thaliana (TAIR10)
Description

peroxin 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839800]

Location
About this transcript

This transcript has 1 exon, is annotated with 26 domains and features, is associated with 118 variant alleles and maps to 46 oligo probes.

Gene

This transcript is a product of gene AT1G29260 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
PEX7-201AT1G29260.11508317aa
 
Protein coding
A0A178WDC3 Q9XF57 -Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • 3 prime UTR
  • 5 prime UTR
  • Missense
  • Synonymous
Other
  • UTR
Markup
  • loaded
  • Variants are filtered by consequence type
       W       S       R     R Y                      W                   
     1 TAATTCTGCGATGAGCAAAATCGGCGTTATCCGATCAGATCGTTGAATTGAATCTTCGAG     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                     K                **                    R  K          
    61 AAGACTCTTCTTTTGATTCAATCACTCACCGGAGAAGAAGAAGAAGCTATGCCGGTGTTC    120
       ................................................ATGCCGGTGTTC     12
       ................................................-M--P--V--F-      4

                                                      R                   
   121 AAAGCTCCGTTCAATGGCTACTCTGTGAAATTCAGTCCATTCTACGAGTCACGCCTCGCC    180
    13 AAAGCTCCGTTCAATGGCTACTCTGTGAAATTCAGTCCATTCTACGAGTCACGCCTCGCC     72
     5 -K--A--P--F--N--G--Y--S--V--K--F--S--P--F--Y--E--S--R--L--A-     24

               W                               R                          
   181 GTCGCTACAGCTCAGAACTTCGGAATTCTCGGAAACGGCCGAATCCATGTCCTCGAGCTC    240
    73 GTCGCTACAGCTCAGAACTTCGGAATTCTCGGAAACGGCCGAATCCATGTCCTCGAGCTC    132
    25 -V--A--T--A--Q--N--F--G--I--L--G--N--G--R--I--H--V--L--E--L-     44

                                                W                         
   241 GCTCCTGGAGCTCCAGGCGTAACTGAATCCGTCTCGTACGATACAGCCGACGCTGTATAC    300
   133 GCTCCTGGAGCTCCAGGCGTAACTGAATCCGTCTCGTACGATACAGCCGACGCTGTATAC    192
    45 -A--P--G--A--P--G--V--T--E--S--V--S--Y--D--T--A--D--A--V--Y-     64

                                       K             W                    
   301 GACGTATGTTGGTCAGAATCTCATGACTCTGTGCTCATCGCCGCAATTGGTGACGGCTCA    360
   193 GACGTATGTTGGTCAGAATCTCATGACTCTGTGCTCATCGCCGCAATTGGTGACGGCTCA    252
    65 -D--V--C--W--S--E--S--H--D--S--V--L--I--A--A--I--G--D--G--S-     84

                                Y                                         
   361 GTGAAGATTTACGACACAGCTCTTCCTCCTCCTTCTAATCCGATTAGATCATTCCAAGAG    420
   253 GTGAAGATTTACGACACAGCTCTTCCTCCTCCTTCTAATCCGATTAGATCATTCCAAGAG    312
    85 -V--K--I--Y--D--T--A--L--P--P--P--S--N--P--I--R--S--F--Q--E-    104

                                                                          
   421 CACGCGCGTGAGGTTCAATCTGTGGATTACAATCCCACGCGGCGCGATTCGTTTCTCACT    480
   313 CACGCGCGTGAGGTTCAATCTGTGGATTACAATCCCACGCGGCGCGATTCGTTTCTCACT    372
   105 -H--A--R--E--V--Q--S--V--D--Y--N--P--T--R--R--D--S--F--L--T-    124

                                                Y                         
   481 TCTTCGTGGGATGATACGGTTAAGCTTTGGGCTATGGATCGTCCGGCGAGTGTAAGGACT    540
   373 TCTTCGTGGGATGATACGGTTAAGCTTTGGGCTATGGATCGTCCGGCGAGTGTAAGGACT    432
   125 -S--S--W--D--D--T--V--K--L--W--A--M--D--R--P--A--S--V--R--T-    144

         W          S                                                     
   541 TTTAAGGAACATGCTTATTGCGTTTATCAAGCAGTTTGGAATCCTAAACATGGTGATGTG    600
   433 TTTAAGGAACATGCTTATTGCGTTTATCAAGCAGTTTGGAATCCTAAACATGGTGATGTG    492
   145 -F--K--E--H--A--Y--C--V--Y--Q--A--V--W--N--P--K--H--G--D--V-    164

           Y                           R                        W         
   601 TTTGCTTCTGCTTCTGGAGATTGTACTTTAAGGATTTGGGATGTTAGAGAACCTGGATCA    660
   493 TTTGCTTCTGCTTCTGGAGATTGTACTTTAAGGATTTGGGATGTTAGAGAACCTGGATCA    552
   165 -F--A--S--A--S--G--D--C--T--L--R--I--W--D--V--R--E--P--G--S-    184

                                                                          
   661 ACTATGATCATCCCTGCTCATGATTTTGAGATTTTGTCTTGTGATTGGAATAAGTATGAT    720
   553 ACTATGATCATCCCTGCTCATGATTTTGAGATTTTGTCTTGTGATTGGAATAAGTATGAT    612
   185 -T--M--I--I--P--A--H--D--F--E--I--L--S--C--D--W--N--K--Y--D-    204

                                 R  Y           R                         
   721 GATTGTATTTTAGCTACTTCTTCAGTGGATAAGACAGTTAAGGTTTGGGATGTTAGGAGT    780
   613 GATTGTATTTTAGCTACTTCTTCAGTGGATAAGACAGTTAAGGTTTGGGATGTTAGGAGT    672
   205 -D--C--I--L--A--T--S--S--V--D--K--T--V--K--V--W--D--V--R--S-    224

       Y Y         Y                                                      
   781 TATAGAGTTCCTTTGGCTGTGCTTAATGGTCATGGATATGCGGTGAGGAAGGTGAAATTC    840
   673 TATAGAGTTCCTTTGGCTGTGCTTAATGGTCATGGATATGCGGTGAGGAAGGTGAAATTC    732
   225 -Y--R--V--P--L--A--V--L--N--G--H--G--Y--A--V--R--K--V--K--F-    244

                                                                          
   841 TCGCCGCATAGGAGGAGTTTGATAGCTTCTTGCTCTTATGATATGAGTGTTTGTCTTTGG    900
   733 TCGCCGCATAGGAGGAGTTTGATAGCTTCTTGCTCTTATGATATGAGTGTTTGTCTTTGG    792
   245 -S--P--H--R--R--S--L--I--A--S--C--S--Y--D--M--S--V--C--L--W-    264

                              R           Y                               
   901 GACTATATGGTGGAAGATGCTTTGGTTGGTAGGTATGATCATCATACAGAGTTTGCTGTT    960
   793 GACTATATGGTGGAAGATGCTTTGGTTGGTAGGTATGATCATCATACAGAGTTTGCTGTT    852
   265 -D--Y--M--V--E--D--A--L--V--G--R--Y--D--H--H--T--E--F--A--V-    284

                                             R                            
   961 GGGATCGATATGAGTGTTCTTGTTGAAGGTTTAATGGCGAGTACTGGTTGGGATGAGCTT   1020
   853 GGGATCGATATGAGTGTTCTTGTTGAAGGTTTAATGGCGAGTACTGGTTGGGATGAGCTT    912
   285 -G--I--D--M--S--V--L--V--E--G--L--M--A--S--T--G--W--D--E--L-    304

               Y                    W S   S                               
  1021 GTTTATGTTTGGCAGCAAGGGATGGATCCTAGAGCCAGTTGATTCATAAGTAAGTTTGTG   1080
   913 GTTTATGTTTGGCAGCAAGGGATGGATCCTAGAGCCAGTTGA..................    954
   305 -V--Y--V--W--Q--Q--G--M--D--P--R--A--S--*-..................    317

                                WD                 *       W              
  1081 ATTGCAAAACAGTTTCATCTTTATTTGTTGTGGAATTGGTTTGGTTTTTGTTAAAGGAAT   1140
       ............................................................       
       ............................................................       

                      K          Y            R          *      SM        
  1141 GTAGTTGGAATAAAGTTGGGATCTTGCTTAAGAAGAAATGTAAGTTACTGAGAGTTTCAC   1200
       ............................................................       
       ............................................................       

                           Y               R  M           Y               
  1201 ATATGAACAAGGTTATCTTTCGAATTGTGATTGATGGTAATAGTAGATAGATTGCTTATG   1260
       ............................................................       
       ............................................................       

                    R            *              R   R                     
  1261 TTCTAGTGTATATGTTAACCTGTTACAATGAGACCTGATTAACATATATATTAGGACTAA   1320
       ............................................................       
       ............................................................       

        R*                W   K        R    **  **       W       W        
  1321 GATATATGTTAATCTTCTATAATGTCCAAAGTAATGACATAATATATATAAAGTCAATTA   1380
       ............................................................       
       ............................................................       

             K      K          R             Y R          Y               
  1381 CTTTAGGGTAATGTACCTTTTATAGTATACTGTAGAATTCGAATTTTGTTCTTTTTCATA   1440
       ............................................................       
       ............................................................       

                                 R          Y            R R              
  1441 GTTGATTGACTTTATTGAGTGGCATAAATGTACATATTTATAACTTTCTAGAGCATATTG   1500
       ............................................................       
       ............................................................       

            W                                                             
  1501 CAGTTTCG                                                       1508
       ........                                                           
       ........