Transcript: AT1G29260.1 PEX7-201
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Description
peroxin 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839800 ]
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PEX7-201 AT1G29260.1 1508 317aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A178WDC3 Q9XF57 - A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants 3 prime UTR 5 prime UTR Missense Synonymous Other Markup Variants are filtered by consequence type ▼ ▲
Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants 3 prime UTR 5 prime UTR Missense Synonymous Other Markup Variants are filtered by consequence type
W S R R Y W
1 AATTCTG GATGAGC AAATC G GTTATCCGATCAGATCGTTGAA TGAATCTTCGAG 60
............................................................
............................................................
K ** R K
61 AAGACTCTTCTTTT ATTCAATCACTCACCG GAAGAAGAAGAAGCT ATG CC GT TTC 120
................................................ATGCCGGTGTTC 12
................................................-M--P--V--F- 4
R
121 AAA GCT CCG TTC AAT GGC TAC TCT GTG AAA TTC AGT CCA TTC TAC GA TCA CGC CTC GCC 180
13 AAAGCTCCGTTCAATGGCTACTCTGTGAAATTCAGTCCATTCTACGAGTCACGCCTCGCC 72
5 -K--A--P--F--N--G--Y--S--V--K--F--S--P--F--Y--E--S--R--L--A- 24
W R
181 GTC GCT AC GCT CAG AAC TTC GGA ATT CTC GGA AAC GGC C A ATC CAT GTC CTC GAG CTC 240
73 GTCGCTACAGCTCAGAACTTCGGAATTCTCGGAAACGGCCGAATCCATGTCCTCGAGCTC 132
25 -V--A--T--A--Q--N--F--G--I--L--G--N--G- -R- -I--H--V--L--E--L- 44
W
241 GCT CCT GGA GCT CCA GGC GTA ACT GAA TCC GTC TCG TAC GA ACA GCC GAC GCT GTA TAC 300
133 GCTCCTGGAGCTCCAGGCGTAACTGAATCCGTCTCGTACGATACAGCCGACGCTGTATAC 192
45 -A--P--G--A--P--G--V--T--E--S--V--S--Y- -D- -T--A--D--A--V--Y- 64
K W
301 GAC GTA TGT TGG TCA GAA TCT CAT GAC TCT GT CTC ATC GCC GCA A T GGT GAC GGC TCA 360
193 GACGTATGTTGGTCAGAATCTCATGACTCTGTGCTCATCGCCGCAATTGGTGACGGCTCA 252
65 -D--V--C--W--S--E--S--H--D--S--V--L--I--A--A- -I- -G--D--G--S- 84
Y
361 GTG AAG ATT TAC GAC ACA GCT CTT C T CCT CCT TCT AAT CCG ATT AGA TCA TTC CAA GAG 420
253 GTGAAGATTTACGACACAGCTCTTCCTCCTCCTTCTAATCCGATTAGATCATTCCAAGAG 312
85 -V--K--I--Y--D--T--A--L- -P- -P--P--S--N--P--I--R--S--F--Q--E- 104
421 CAC GCG CGT GAG GTT CAA TCT GTG GAT TAC AAT CCC ACG CGG CGC GAT TCG TTT CTC ACT 480
313 CACGCGCGTGAGGTTCAATCTGTGGATTACAATCCCACGCGGCGCGATTCGTTTCTCACT 372
105 -H--A--R--E--V--Q--S--V--D--Y--N--P--T--R--R--D--S--F--L--T- 124
Y
481 TCT TCG TGG GAT GAT ACG GTT AAG CTT TGG GCT ATG GAT CG CCG GCG AGT GTA AGG ACT 540
373 TCTTCGTGGGATGATACGGTTAAGCTTTGGGCTATGGATCGTCCGGCGAGTGTAAGGACT 432
125 -S--S--W--D--D--T--V--K--L--W--A--M--D--R--P--A--S--V--R--T- 144
W S
541 TT AAG GAA CAT G T TAT TGC GTT TAT CAA GCA GTT TGG AAT CCT AAA CAT GGT GAT GTG 600
433 TTTAAGGAACATGCTTATTGCGTTTATCAAGCAGTTTGGAATCCTAAACATGGTGATGTG 492
145 -F- -K--E--H- -A- -Y--C--V--Y--Q--A--V--W--N--P--K--H--G--D--V- 164
Y R W
601 TTT G T TCT GCT TCT GGA GAT TGT ACT TTA AG ATT TGG GAT GTT AGA GAA CCT GGA CA 660
493 TTTGCTTCTGCTTCTGGAGATTGTACTTTAAGGATTTGGGATGTTAGAGAACCTGGATCA 552
165 -F- -A- -S--A--S--G--D--C--T--L--R--I--W--D--V--R--E--P--G- -S- 184
661 ACT ATG ATC ATC CCT GCT CAT GAT TTT GAG ATT TTG TCT TGT GAT TGG AAT AAG TAT GAT 720
553 ACTATGATCATCCCTGCTCATGATTTTGAGATTTTGTCTTGTGATTGGAATAAGTATGAT 612
185 -T--M--I--I--P--A--H--D--F--E--I--L--S--C--D--W--N--K--Y--D- 204
R Y R
721 GAT TGT ATT TTA GCT ACT TCT TCA GT GA AAG ACA GTT AA GTT TGG GAT GTT AGG AGT 780
613 GATTGTATTTTAGCTACTTCTTCAGTGGATAAGACAGTTAAGGTTTGGGATGTTAGGAGT 672
205 -D--C--I--L--A--T--S--S--V--D--K--T--V--K--V--W--D--V--R--S- 224
Y Y Y
781 A AGA GTT CCT TG GCT GTG CTT AAT GGT CAT GGA TAT GCG GTG AGG AAG GTG AAA TTC 840
673 TATAGAGTTCCTTTGGCTGTGCTTAATGGTCATGGATATGCGGTGAGGAAGGTGAAATTC 732
225 -Y- -R--V--P--L--A--V--L--N--G--H--G--Y--A--V--R--K--V--K--F- 244
841 TCG CCG CAT AGG AGG AGT TTG ATA GCT TCT TGC TCT TAT GAT ATG AGT GTT TGT CTT TGG 900
733 TCGCCGCATAGGAGGAGTTTGATAGCTTCTTGCTCTTATGATATGAGTGTTTGTCTTTGG 792
245 -S--P--H--R--R--S--L--I--A--S--C--S--Y--D--M--S--V--C--L--W- 264
R Y
901 GAC TAT ATG GTG GAA GAT GCT TT GTT GGT AGG TA GAT CAT CAT ACA GAG TTT GCT GTT 960
793 GACTATATGGTGGAAGATGCTTTGGTTGGTAGGTATGATCATCATACAGAGTTTGCTGTT 852
265 -D--Y--M--V--E--D--A--L--V--G--R--Y--D--H--H--T--E--F--A--V- 284
R
961 GGG ATC GAT ATG AGT GTT CTT GTT GAA GGT TTA ATG GC AGT ACT GGT TGG GAT GAG CTT 1020
853 GGGATCGATATGAGTGTTCTTGTTGAAGGTTTAATGGCGAGTACTGGTTGGGATGAGCTT 912
285 -G--I--D--M--S--V--L--V--E--G--L--M--A--S--T--G--W--D--E--L- 304
Y W S S
1021 GTT TAT GT TGG CAG CAA GGG ATG GAT CC A A GC AGT TGA TTCATAAGTAAGTTTGTG 1080
913 GTTTATGTTTGGCAGCAAGGGATGGATCCTAGAGCCAGTTGA.................. 954
305 -V--Y--V--W--Q--Q--G--M--D--P- -R- -A--S--*-.................. 317
W D * W
1081 ATTGCAAAACAGTTTCATCTTTATT TTGTGGAATTGGTTTGG TTTTGTT AAGGAAT 1140
............................................................
............................................................
K Y R * S M
1141 GTAGTTGGAATAAAG TGGGATCTTG TTAAGAAGAAAT TAAGTTACTG GAGTTT C 1200
............................................................
............................................................
Y R M Y
1201 ATATGAACAAGGTTATCTTT GAATTGTGATTGATG TA TAGTAGATAGA TGCTTATG 1260
............................................................
............................................................
R * R R
1261 TTCTAGTGTATAT TTAACCTGTTAC ATGAGACCTGATTA CAT TATATTAGGACTAA 1320
............................................................
............................................................
R * W K R ** ** W W
1321 G ATATGTTAATCTTCTA AAT TCCAAAGT ATGA TA ATATATA AGTCAAT A 1380
............................................................
............................................................
K K R Y R Y
1381 CTTTAG GTAATG ACCTTTTATA TATACTGTAGAAT C AATTTTGTTC TTTTCATA 1440
............................................................
............................................................
R Y R R
1441 GTTGATTGACTTTATTGAGTGGCATA ATGTACATAT TATAACTTTCTA A CATATTG 1500
............................................................
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W
1501 CAGTT CG 1508
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