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Arabidopsis thaliana (TAIR10)
Description

NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839286]

Location
About this transcript

This transcript has 15 exons, is annotated with 9 domains and features, is associated with 214 variant alleles and maps to 44 oligo probes.

Gene

This transcript is a product of gene AT1G05180 Show transcript tableHide transcript table

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  • Name
  • Transcript ID
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
AXR1-203AT1G05180.12044540aa
 
Protein coding
A0A178WFT2 P42744 -Ensembl Canonical
AXR1-202AT1G05180.31942422aa
 
Protein coding
F4I7A4 --
AXR1-201AT1G05180.21817436aa
 
Protein coding
F4I7A3 --
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
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  • Another exon
Variants
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Other
  • UTR
Markup
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     1 TTTATCAGTTCACCGGAGGCAAAAATCGTCTCTCGCTTGAGCTGCGAAGATGCAAGCAGT     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 AAAAAGATCCAGGAGACATGTTGAAGAAGAGCCAACAATGGTAGAACCTAAAACCAAGTA    120
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   121 CGATCGTCAGCTCAGGATTTGGGGGGAGGTAGGTCAAGCGGCCTTGGAAGAAGCGAGTAT    180
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   181 CTGTTTACTCAATTGTGGCCCTACTGGTTCCGAGGCTTTGAAGAATCTCGTACTTGGTGG    240
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   241 TGTTGGTAGCATCACCGTTGTTGATGGATCTAAGGTTCAATTTGGTGACCTTGGGAACAA    300
       .......................ATGGATCTAAGGTTCAATTTGGTGACCTTGGGAACAA     37
       .......................-M--D--L--R--F--N--L--V--T--L--G--T--     12

                                                                          
   301 TTTCATGGTCGATGCGAAGAGTGTTGGCCAATCAAAAGCCAAATCTGTTTTTCACTCTCG    360
    38 TTTCATGGTCGATGCGAAGAGTGTTGGCCAATCAAAAGCCAAATCTGTTTTTCACTCTCG     97
    13 I--S--W--S--M--R--R--V--L--A--N--Q--K--P--N--L--F--F--T--L--     32

                                                                          
   361 TTATAGCCACTCAGCTGGTGGAAGATTCAATGTTGAAACTTGATAGAATCTGTCGAGATG    420
    98 TTATAGCCACTCAGCTGGTGGAAGATTCAATGTTGAAACTTGATAGAATCTGTCGAGATG    157
    33 V--I--A--T--Q--L--V--E--D--S--M--L--K--L--D--R--I--C--R--D--     52

                                                                          
   421 CAAACGTTAAGTTGGTTTTGGTTCGCTCTTATGGCCTTGCTGGGTTTGTTCGCATCTCTG    480
   158 CAAACGTTAAGTTGGTTTTGGTTCGCTCTTATGGCCTTGCTGGGTTTGTTCGCATCTCTG    217
    53 A--N--V--K--L--V--L--V--R--S--Y--G--L--A--G--F--V--R--I--S--     72

                                                                          
   481 TAAAGGAGCACCCCATAATTGACTCAAAACCTGATCATTTTCTTGACGACCTCCGCCTGA    540
   218 TAAAGGAGCACCCCATAATTGACTCAAAACCTGATCATTTTCTTGACGACCTCCGCCTGA    277
    73 V--K--E--H--P--I--I--D--S--K--P--D--H--F--L--D--D--L--R--L--     92

                                                                          
   541 ATAATCCATGGCCTGAACTCAAGAGTTTTGTGGAGACCATTGATCTGAATGTATCAGAGC    600
   278 ATAATCCATGGCCTGAACTCAAGAGTTTTGTGGAGACCATTGATCTGAATGTATCAGAGC    337
    93 N--N--P--W--P--E--L--K--S--F--V--E--T--I--D--L--N--V--S--E--    112

                                                                          
   601 CGGCCGCTGCACATAAGCACATACCTTACGTCGTCATTCTTGTAAAGATGGCTGAGGAGT    660
   338 CGGCCGCTGCACATAAGCACATACCTTACGTCGTCATTCTTGTAAAGATGGCTGAGGAGT    397
   113 P--A--A--A--H--K--H--I--P--Y--V--V--I--L--V--K--M--A--E--E--    132

                                                                          
   661 GGGCTCAATCCCATAGTGGTAATCTTCCCTCAACCAGGGAAGAGAAAAAAGAGTTTAAGG    720
   398 GGGCTCAATCCCATAGTGGTAATCTTCCCTCAACCAGGGAAGAGAAAAAAGAGTTTAAGG    457
   133 W--A--Q--S--H--S--G--N--L--P--S--T--R--E--E--K--K--E--F--K--    152

                                                                          
   721 ATTTGGTTAAGTCCAAGATGGTATCTACGGATGAAGATAACTACAAAGAAGCCATTGAAG    780
   458 ATTTGGTTAAGTCCAAGATGGTATCTACGGATGAAGATAACTACAAAGAAGCCATTGAAG    517
   153 D--L--V--K--S--K--M--V--S--T--D--E--D--N--Y--K--E--A--I--E--    172

                                                                          
   781 CCGCTTTCAAAGTTTTTGCTCCTCGAGGAATCAGCTCAGAGGTTCAAAAATTAATTAATG    840
   518 CCGCTTTCAAAGTTTTTGCTCCTCGAGGAATCAGCTCAGAGGTTCAAAAATTAATTAATG    577
   173 A--A--F--K--V--F--A--P--R--G--I--S--S--E--V--Q--K--L--I--N--    192

                                                                          
   841 ATAGTTGTGCTGAAGTGAATTCAAACTCCTCAGCTTTTTGGGTGATGGTAGCGGCTCTGA    900
   578 ATAGTTGTGCTGAAGTGAATTCAAACTCCTCAGCTTTTTGGGTGATGGTAGCGGCTCTGA    637
   193 D--S--C--A--E--V--N--S--N--S--S--A--F--W--V--M--V--A--A--L--    212

                                                                          
   901 AGGAGTTTGTTTTAAATGAAGGTGGTGGAGAGGCACCCCTTGAAGGTTCTATACCAGATA    960
   638 AGGAGTTTGTTTTAAATGAAGGTGGTGGAGAGGCACCCCTTGAAGGTTCTATACCAGATA    697
   213 K--E--F--V--L--N--E--G--G--G--E--A--P--L--E--G--S--I--P--D--    232

                                                                          
   961 TGACCTCTTCAACAGAACACTATATCAATTTGCAGAAAATCTATTTAGCCAAAGCCGAGG   1020
   698 TGACCTCTTCAACAGAACACTATATCAATTTGCAGAAAATCTATTTAGCCAAAGCCGAGG    757
   233 M--T--S--S--T--E--H--Y--I--N--L--Q--K--I--Y--L--A--K--A--E--    252

                                                                          
  1021 CTGATTTTCTTGTCATTGAGGAACGAGTTAAAAACATTTTAAAGAAAATCGGTCGAGATC   1080
   758 CTGATTTTCTTGTCATTGAGGAACGAGTTAAAAACATTTTAAAGAAAATCGGTCGAGATC    817
   253 A--D--F--L--V--I--E--E--R--V--K--N--I--L--K--K--I--G--R--D--    272

                                                                          
  1081 CGAGCAGCATCCCAAAACCAACAATCAAGAGCTTCTGCAAGAATGCAAGGAAACTTAAAT   1140
   818 CGAGCAGCATCCCAAAACCAACAATCAAGAGCTTCTGCAAGAATGCAAGGAAACTTAAAT    877
   273 P--S--S--I--P--K--P--T--I--K--S--F--C--K--N--A--R--K--L--K--    292

                                                                          
  1141 TGTGCAGATATCGTATGGTAGAGGACGAGTTCAGAAATCCTTCTGTAACTGAAATTCAAA   1200
   878 TGTGCAGATATCGTATGGTAGAGGACGAGTTCAGAAATCCTTCTGTAACTGAAATTCAAA    937
   293 L--C--R--Y--R--M--V--E--D--E--F--R--N--P--S--V--T--E--I--Q--    312

                                                                          
  1201 AGTATTTAGCGGACGAGGATTACAGTGGTGCAATGGGATTTTATATTCTTCTTAGAGCTG   1260
   938 AGTATTTAGCGGACGAGGATTACAGTGGTGCAATGGGATTTTATATTCTTCTTAGAGCTG    997
   313 K--Y--L--A--D--E--D--Y--S--G--A--M--G--F--Y--I--L--L--R--A--    332

                                                                          
  1261 CGGACAGATTTGCTGCCAACTATAACAAGTTTCCTGGGCAGTTTGATGGAGGAATGGATG   1320
   998 CGGACAGATTTGCTGCCAACTATAACAAGTTTCCTGGGCAGTTTGATGGAGGAATGGATG   1057
   333 A--D--R--F--A--A--N--Y--N--K--F--P--G--Q--F--D--G--G--M--D--    352

                                                                          
  1321 AGGACATTTCTCGATTAAAAACTACTGCCTTGAGTCTTCTTACCGACTTGGGCTGTAACG   1380
  1058 AGGACATTTCTCGATTAAAAACTACTGCCTTGAGTCTTCTTACCGACTTGGGCTGTAACG   1117
   353 E--D--I--S--R--L--K--T--T--A--L--S--L--L--T--D--L--G--C--N--    372

                                                                          
  1381 GCTCAGTACTCCCAGATGACCTTATCCATGAGATGTGTCGCTTTGGTGCCTCAGAGATTC   1440
  1118 GCTCAGTACTCCCAGATGACCTTATCCATGAGATGTGTCGCTTTGGTGCCTCAGAGATTC   1177
   373 G--S--V--L--P--D--D--L--I--H--E--M--C--R--F--G--A--S--E--I--    392

                                                                          
  1441 ATGTGGTTTCTGCCTTTGTTGGAGGAATCGCATCTCAAGAAGTCATCAAGCTTGTCACAA   1500
  1178 ATGTGGTTTCTGCCTTTGTTGGAGGAATCGCATCTCAAGAAGTCATCAAGCTTGTCACAA   1237
   393 H--V--V--S--A--F--V--G--G--I--A--S--Q--E--V--I--K--L--V--T--    412

                                                                          
  1501 AGCAGTTTGTTCCGATGTTGGGGACTTACATCTTCAATGGCATTGATCACAAGTCTCAGT   1560
  1238 AGCAGTTTGTTCCGATGTTGGGGACTTACATCTTCAATGGCATTGATCACAAGTCTCAGT   1297
   413 K--Q--F--V--P--M--L--G--T--Y--I--F--N--G--I--D--H--K--S--Q--    432

                                                                          
  1561 TATTGAAATTGTAGAAGATCTTTCCTTAACACATTGGCTTGAAACAGAGAGAAAGAGCTC   1620
  1298 TATTGAAATTGTAG..............................................   1311
   433 L--L--K--L--*-..............................................    436

                                                                          
  1621 TATCATATATTATTCTTCTGATTAAAAGATAATCTTTTTGCTACTACTGAGAAACAAAAT   1680
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1681 TTTCAATGACAGTTCAGCTGAGACCATCCGACTCAGAATCTTCGAAAATCTTGCTTTGCT   1740
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1741 TTGTCCTTGAGGTTAGAAATATTTGAAGGTTAAATGAAGCTAATCTCATAAAATGGGCCA   1800
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1801 CTGTAAGCCCATTCTAC                                              1817
       .................                                                  
       .................