Transcript: AT1G05180.2 AXR1-201
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Description
NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839286 ]
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AXR1-203 AT1G05180.1 2044 540aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A178WFT2 P42744 - A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical, AXR1-202 AT1G05180.3 1942 422aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
F4I7A4 - - AXR1-201 AT1G05180.2 1817 436aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
F4I7A3 - -
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 T TTATCAGTTCACCGGAGGCAAAAATCGTCTCTCGCTTGAGCTGCGAAGATGCAAGCAGT 60
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61 AAAAAGATCCAGGAGACATGTTGAAGAAGAGCCAACAATGGTAGAACCTAAAACCAAGTA 120
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............................................................
121 CGATCGTCAGCTCAG GATTTGGGGGGAGGTAGGTCAAGCGGCCTTGGAAGAAGCGAGTAT 180
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............................................................
181 CTGTTTACTCAATTGTGGCCCTACTGGTTCCGAGGCTTTGAAGAATCTCGTACTTGGTGG 240
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241 TGTTGGTAGCATCACCGTTGTTG ATG GAT CTA AGG TTC AAT TTG GTG ACC TTG GGA ACA A 300
.......................ATGGATCTAAGGTTCAATTTGGTGACCTTGGGAACAA 37
.......................-M--D--L--R--F--N--L--V--T--L--G--T-- 12
301 TT TCA TGG TCG ATG CGA AGA GTG TTG GCC AAT CAA AAG CCA AAT CTG TTT T TC ACT CTC G 360
38 TTTCATGGTCGATGCGAAGAGTGTTGGCCAATCAAAAGCCAAATCTGTTTTTCACTCTCG 97
13 I--S--W--S--M--R--R--V--L--A--N--Q--K--P--N--L--F--F--T--L-- 32
361 TT ATA GCC ACT CAG CTG GTG GAA GAT TCA ATG TTG AAA CTT GAT AGA ATC TGT CGA GAT G 420
98 TTATAGCCACTCAGCTGGTGGAAGATTCAATGTTGAAACTTGATAGAATCTGTCGAGATG 157
33 V--I--A--T--Q--L--V--E--D--S--M--L--K--L--D--R--I--C--R--D-- 52
421 CA AAC GTT AAG TTG GTT TTG GTT CGC TCT TAT GGC CTT GCT GGG TTT GTT CGC ATC TCT G 480
158 CAAACGTTAAGTTGGTTTTGGTTCGCTCTTATGGCCTTGCTGGGTTTGTTCGCATCTCTG 217
53 A--N--V--K--L--V--L--V--R--S--Y--G--L--A--G--F--V--R--I--S-- 72
481 TA AAG G AG CAC CCC ATA ATT GAC TCA AAA CCT GAT CAT TTT CTT GAC GAC CTC CGC CTG A 540
218 TAAAGGAGCACCCCATAATTGACTCAAAACCTGATCATTTTCTTGACGACCTCCGCCTGA 277
73 V--K--E--H--P--I--I--D--S--K--P--D--H--F--L--D--D--L--R--L-- 92
541 AT AAT CCA TGG CCT GAA CTC AAG AG T TTT GTG GAG ACC ATT GAT CTG AAT GTA TCA GAG C 600
278 ATAATCCATGGCCTGAACTCAAGAGTTTTGTGGAGACCATTGATCTGAATGTATCAGAGC 337
93 N--N--P--W--P--E--L--K--S--F--V--E--T--I--D--L--N--V--S--E-- 112
601 CG GCC GCT GCA CAT AAG CAC ATA CCT TAC GTC GTC ATT CTT GTA AAG ATG GCT GAG GAG T 660
338 CGGCCGCTGCACATAAGCACATACCTTACGTCGTCATTCTTGTAAAGATGGCTGAGGAGT 397
113 P--A--A--A--H--K--H--I--P--Y--V--V--I--L--V--K--M--A--E--E-- 132
661 GG GCT CAA TCC CAT AGT GGT AAT CTT CCC TCA ACC AGG GAA GAG AAA AAA GAG TTT AAG G 720
398 GGGCTCAATCCCATAGTGGTAATCTTCCCTCAACCAGGGAAGAGAAAAAAGAGTTTAAGG 457
133 W--A--Q--S--H--S--G--N--L--P--S--T--R--E--E--K--K--E--F--K-- 152
721 AT TTG GTT AAG TCC AAG ATG GTA TCT ACG GAT GAA GAT AAC TAC AAA GAA GCC ATT GAA G 780
458 ATTTGGTTAAGTCCAAGATGGTATCTACGGATGAAGATAACTACAAAGAAGCCATTGAAG 517
153 D--L--V--K--S--K--M--V--S--T--D--E--D--N--Y--K--E--A--I--E-- 172
781 CC GCT TTC AAA GTT TTT GCT CCT CGA GGA ATC A GC TCA GAG GTT CAA AAA TTA ATT AAT G 840
518 CCGCTTTCAAAGTTTTTGCTCCTCGAGGAATCAGCTCAGAGGTTCAAAAATTAATTAATG 577
173 A--A--F--K--V--F--A--P--R--G--I--S--S--E--V--Q--K--L--I--N-- 192
841 AT AGT TGT GCT GAA GTG AAT TCA AAC TCC TCA GCT TTT TGG GTG ATG GTA GCG GCT CTG A 900
578 ATAGTTGTGCTGAAGTGAATTCAAACTCCTCAGCTTTTTGGGTGATGGTAGCGGCTCTGA 637
193 D--S--C--A--E--V--N--S--N--S--S--A--F--W--V--M--V--A--A--L-- 212
901 AG GAG TTT GTT TTA AAT GAA GGT GGT GGA GAG GCA CCC CTT GAA GGT TCT ATA CCA GAT A 960
638 AGGAGTTTGTTTTAAATGAAGGTGGTGGAGAGGCACCCCTTGAAGGTTCTATACCAGATA 697
213 K--E--F--V--L--N--E--G--G--G--E--A--P--L--E--G--S--I--P--D-- 232
961 TG ACC TCT TCA ACA GA A CAC TAT ATC AAT TTG CAG AAA ATC TAT TTA GCC AAA GCC GAG G 1020
698 TGACCTCTTCAACAGAACACTATATCAATTTGCAGAAAATCTATTTAGCCAAAGCCGAGG 757
233 M--T--S--S--T--E--H--Y--I--N--L--Q--K--I--Y--L--A--K--A--E-- 252
1021 CT GAT TTT CTT GTC ATT GAG GAA CGA GTT AAA AAC ATT TTA AAG AAA ATC GGT CGA GAT C 1080
758 CTGATTTTCTTGTCATTGAGGAACGAGTTAAAAACATTTTAAAGAAAATCGGTCGAGATC 817
253 A--D--F--L--V--I--E--E--R--V--K--N--I--L--K--K--I--G--R--D-- 272
1081 CG AGC AGC ATC CCA AAA CCA ACA ATC AAG AGC TTC TGC AAG AAT GCA AGG AAA CTT AAA T 1140
818 CGAGCAGCATCCCAAAACCAACAATCAAGAGCTTCTGCAAGAATGCAAGGAAACTTAAAT 877
273 P--S--S--I--P--K--P--T--I--K--S--F--C--K--N--A--R--K--L--K-- 292
1141 TG TGC AGA TAT CGT ATG GTA GAG GAC GAG TTC AGA AAT CCT TCT GTA ACT GAA ATT CAA A 1200
878 TGTGCAGATATCGTATGGTAGAGGACGAGTTCAGAAATCCTTCTGTAACTGAAATTCAAA 937
293 L--C--R--Y--R--M--V--E--D--E--F--R--N--P--S--V--T--E--I--Q-- 312
1201 AG TAT TTA GCG GAC GAG GAT TAC AG T GGT GCA ATG GGA TTT TAT ATT CTT CTT AGA GCT G 1260
938 AGTATTTAGCGGACGAGGATTACAGTGGTGCAATGGGATTTTATATTCTTCTTAGAGCTG 997
313 K--Y--L--A--D--E--D--Y--S--G--A--M--G--F--Y--I--L--L--R--A-- 332
1261 CG GAC AGA TTT GCT GCC AAC TAT AAC AAG TTT CCT GGG CAG TTT GAT GG A GGA ATG GAT G 1320
998 CGGACAGATTTGCTGCCAACTATAACAAGTTTCCTGGGCAGTTTGATGGAGGAATGGATG 1057
333 A--D--R--F--A--A--N--Y--N--K--F--P--G--Q--F--D--G--G--M--D-- 352
1321 AG GAC ATT TCT CGA TTA AAA ACT ACT GCC TTG AGT CTT CTT ACC GAC TTG GGC TGT AAC G 1380
1058 AGGACATTTCTCGATTAAAAACTACTGCCTTGAGTCTTCTTACCGACTTGGGCTGTAACG 1117
353 E--D--I--S--R--L--K--T--T--A--L--S--L--L--T--D--L--G--C--N-- 372
1381 GC TCA GTA CTC CCA GAT GAC CTT ATC CAT GAG ATG TGT CGC TTT GGT GCC TCA GAG ATT C 1440
1118 GCTCAGTACTCCCAGATGACCTTATCCATGAGATGTGTCGCTTTGGTGCCTCAGAGATTC 1177
373 G--S--V--L--P--D--D--L--I--H--E--M--C--R--F--G--A--S--E--I-- 392
1441 AT GTG GTT TCT GCC TTT GTT GGA GGA ATC GCA TCT CAA GAA GTC ATC AAG C TT GTC ACA A 1500
1178 ATGTGGTTTCTGCCTTTGTTGGAGGAATCGCATCTCAAGAAGTCATCAAGCTTGTCACAA 1237
393 H--V--V--S--A--F--V--G--G--I--A--S--Q--E--V--I--K--L--V--T-- 412
1501 AG CAG TTT GTT CCG ATG TTG GGG ACT TAC ATC TTC AAT GGC ATT GAT CAC AAG TCT CAG T 1560
1238 AGCAGTTTGTTCCGATGTTGGGGACTTACATCTTCAATGGCATTGATCACAAGTCTCAGT 1297
413 K--Q--F--V--P--M--L--G--T--Y--I--F--N--G--I--D--H--K--S--Q-- 432
1561 TA TTG AAA TTG TAG AAGATCTTTCCTTAACACATTGGCTTGAAACAGAGAGAAAGAGCTC 1620
1298 TATTGAAATTGTAG.............................................. 1311
433 L--L--K--L--*-.............................................. 436
1621 TATCATATATTATTCTTCTGATTAAAAGATAATCTTTTTGCTACTACTGAGAAACAAAAT 1680
............................................................
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1681 TTTCAATGACAGTTCAGCTGAGACCATCCGACTCAGAATCTTCGAAAATCTTGCTTTGCT 1740
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1741 TTGTCCTTGAGGTTAGAAATATTTGAAGGTTAAATGAAGCTAATCTCATAAAATGGGCCA 1800
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1801 CTGTAAGCCCATTCTAC 1817
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