Transcript: AT1G05055.1 GTF2H2-201
.
Description
ral transcription factor II H2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839332 ]
Show/hide columns (1 hidden)
GTF2H2-201 AT1G05055.1 1597 421aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A178W5Z7 Q9ZVN9 - A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
.
Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
G TTCTCTTCTTCTTTTTGTAATTAGGTCTCTTAGACGGTGAGGTTAACG ATG AGT AAT CA .................................................ATGAGTAATCA .................................................-M--S--N--Q A AGA AAG AGA TCA AAC GAT GAA AGA GAA GAA GAG GAC GAC GAA GAT GCG GAA GGT ATC GG AAGAAAGAGATCAAACGATGAAAGAGAAGAAGAGGACGACGAAGATGCGGAAGGTATCGG --R--K--R--S--N--D--E--R--E--E--E--D--D--E--D--A--E--G--I--G C GAG TGG GAG AGA GCT TAT GTT GAC GAC CGA TCC TGG GAG GAG TTG CAA GAG GAT GAG TC CGAGTGGGAGAGAGCTTATGTTGACGACCGATCCTGGGAGGAGTTGCAAGAGGATGAGTC --E--W--E--R--A--Y--V--D--D--R--S--W--E--E--L--Q--E--D--E--S T GGA CTT TTA CGG CCA ATT GAT AAC AGT GCC ATT TAC CAT GCT CAG TAT CGC CGC CGT CT TGGACTTTTACGGCCAATTGATAACAGTGCCATTTACCATGCTCAGTATCGCCGCCGTCT --G--L--L--R--P--I--D--N--S--A--I--Y--H--A--Q--Y--R--R--R--L T CGT ATG CTC TCC GCC GCT GCT GCT GGT ACT CGT ATC CAA AAG GGA CTT ATT CGA TAT CT TCGTATGCTCTCCGCCGCTGCTGCTGGTACTCGTATCCAAAAGGGACTTATTCGATATCT --R--M--L--S--A--A--A--A--G--T--R--I--Q--K--G--L--I--R--Y--L C TAC ATC GTC ATT GAC TTC TCT CGG G CA GCT GCG GAA ATG GAT TTC AGA CCA AGC CGG AT CTACATCGTCATTGACTTCTCTCGGGCAGCTGCGGAAATGGATTTCAGACCAAGCCGGAT --Y--I--V--I--D--F--S--R--A--A--A--E--M--D--F--R--P--S--R--M G GCT ATA ATG GCC AAA CAT GTC GAA GCT TTC ATT AGA GAG TTC TTT GAC CAG AAT CCT CT GGCTATAATGGCCAAACATGTCGAAGCTTTCATTAGAGAGTTCTTTGACCAGAATCCTCT --A--I--M--A--K--H--V--E--A--F--I--R--E--F--F--D--Q--N--P--L G AGT CAA ATT GGG TTG GTC TCT ATA AAA AAT GGA GTT GCG CAT ACA TTA ACA GAT CTT GG GAGTCAAATTGGGTTGGTCTCTATAAAAAATGGAGTTGCGCATACATTAACAGATCTTGG --S--Q--I--G--L--V--S--I--K--N--G--V--A--H--T--L--T--D--L--G T GGT AGT CCT GAG ACT CAC ATC AAA GCG TTG ATG GGG AAG TTG GAA GCT TTG GGT GAC TC TGGTAGTCCTGAGACTCACATCAAAGCGTTGATGGGGAAGTTGGAAGCTTTGGGTGACTC --G--S--P--E--T--H--I--K--A--L--M--G--K--L--E--A--L--G--D--S C TCT TTG CAG AAC GCT CTG GAA CTT GTA CAT GAG CAT CTC AAC CAG GTT CCA TCT TAT GG CTCTTTGCAGAACGCTCTGGAACTTGTACATGAGCATCTCAACCAGGTTCCATCTTATGG --S--L--Q--N--A--L--E--L--V--H--E--H--L--N--Q--V--P--S--Y--G T CAC CGC GAG GTT CTG ATA TTG TAC TCA GCT TTA TGC ACA TGT GAT CCA GGC GAT ATC AT TCACCGCGAGGTTCTGATATTGTACTCAGCTTTATGCACATGTGATCCAGGCGATATCAT --H--R--E--V--L--I--L--Y--S--A--L--C--T--C--D--P--G--D--I--M G GAG ACC ATT CAA AAA TGC AAG AAA TCC AAA TTA AGA TGT TCT GTA ATT GGG CTC TCT GC GGAGACCATTCAAAAATGCAAGAAATCCAAATTAAGATGTTCTGTAATTGGGCTCTCTGC --E--T--I--Q--K--C--K--K--S--K--L--R--C--S--V--I--G--L--S--A A GAA ATG TTC ATA TGT AAA CAC CTC TGC CAG GAA ACT GGC GGA TTG TAT TCA GTT GCA GT AGAAATGTTCATATGTAAACACCTCTGCCAGGAAACTGGCGGATTGTATTCAGTTGCAGT --E--M--F--I--C--K--H--L--C--Q--E--T--G--G--L--Y--S--V--A--V G GAC GAG GTG CAT CTA AAG GAT CTT CTG CTT GAA CAT GCG CCT CCA CCT CCG GCA ATA GC GGACGAGGTGCATCTAAAGGATCTTCTGCTTGAACATGCGCCTCCACCTCCGGCAATAGC --D--E--V--H--L--K--D--L--L--L--E--H--A--P--P--P--P--A--I--A A GAA TTT GCA ATT GCA AAT TTG ATC AAG ATG GGT TTC CCA CAA AGA GCT GCT GAG GGT TC AGAATTTGCAATTGCAAATTTGATCAAGATGGGTTTCCCACAAAGAGCTGCTGAGGGTTC --E--F--A--I--A--N--L--I--K--M--G--F--P--Q--R--A--A--E--G--S A ATG GCG ATT TGT TCG TGT CAT AAG GAA GTT AAG ATT GGA GCT GGT TAC ATG TGC CCA AG AATGGCGATTTGTTCGTGTCATAAGGAAGTTAAGATTGGAGCTGGTTACATGTGCCCAAG --M--A--I--C--S--C--H--K--E--V--K--I--G--A--G--Y--M--C--P--R A TGC AAA GCT CGG GTA TGT GAC CTC CCT ACG GAA TGC ACT ATC TGC GGT CTA ACA CTT GT ATGCAAAGCTCGGGTATGTGACCTCCCTACGGAATGCACTATCTGCGGTCTAACACTTGT --C--K--A--R--V--C--D--L--P--T--E--C--T--I--C--G--L--T--L--V T TCT TCG CCG CAT TTG GCG AGA TCA TAC CAT CAT CTC TTC CCG ATT GCT CCA TTT GAT GA TTCTTCGCCGCATTTGGCGAGATCATACCATCATCTCTTCCCGATTGCTCCATTTGATGA --S--S--P--H--L--A--R--S--Y--H--H--L--F--P--I--A--P--F--D--E G GTG CCT GCA CTT TCA AGT CTG AAT GAT AAT CGG AGA AAA TTG GGA AAG AGT TGT TTT GG GGTGCCTGCACTTTCAAGTCTGAATGATAATCGGAGAAAATTGGGAAAGAGTTGTTTTGG --V--P--A--L--S--S--L--N--D--N--R--R--K--L--G--K--S--C--F--G T TGC CAA CAG AGC CTA ATT GGT GCA G GG AAT AAA CCC GTC CCA TGC GTA ACA TGT CGT AA TTGCCAACAGAGCCTAATTGGTGCAGGGAATAAACCCGTCCCATGCGTAACATGTCGTAA --C--Q--Q--S--L--I--G--A--G--N--K--P--V--P--C--V--T--C--R--K A TGC AAG CAC TAT TTC TGT CTG GAC TGT GAC ATA TAC ATC CAC GAG AGC TTA CAC AAC TG ATGCAAGCACTATTTCTGTCTGGACTGTGACATATACATCCACGAGAGCTTACACAACTG --C--K--H--Y--F--C--L--D--C--D--I--Y--I--H--E--S--L--H--N--C T CCT GGC TGT GAG AGC ATT CAC CGT CCC AAA TCA GTT TCT TTG ATG GAA GAA TGA GAGAA TCCTGGCTGTGAGAGCATTCACCGTCCCAAATCAGTTTCTTTGATGGAAGAATGA..... --P--G--C--E--S--I--H--R--P--K--S--V--S--L--M--E--E--*-..... TGAATGTGTTCACACTTCCAATTATAAATCACAATTGAGATGATGAGAGGAAGCAATTTT ............................................................ ............................................................ TTTTGTGATATAGGATGTTGTAATTGGTCTTATGTCCTTAACCAAAATCTTTCTTCTTTT ............................................................ ............................................................ GTGGACTCTATTGCTCTCTCACAATTGATCCAAAACAAACCGACTCAAATTTTCAGAGAT ............................................................ ............................................................ AGCATTCTTAATTGTTTGATTTTCTATTTAACTTGGGCTTGAAATTTCTTCACTCATGAG ............................................................ ............................................................ AAAACGAACAGTAGTAATAAAGAATTATTTCGGTGGT ..................................... ..................................... .
.
This website requires cookies, and the limited processing of your personal data in order to function. By using the site you are agreeing to this as outlined in our Privacy Policy and Terms of Use
![[RSS logo]](/i/rss_icon_16.png "Ensembl blog"){kind=icon}
![[twitter logo]](/i/twitter.png "Follow us on Twitter!")
