Arabidopsis lyrata (v.1.0) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesGeneral identifiersOligo probesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
Zinc finger family protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:D7MBW5]
Chromosome 7: 4,769,153-4,770,646 reverse strand.
This transcript has 1 exon and is annotated with 22 domains and features.
This transcript is a product of gene scaffold_701180.1 Show transcript tableHide transcript table
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1 TTCCTTTTCTCTCTCACACTTATGAAATTTTCTCGGGAAAATATGAAATGGGTTTTTCCA 60 .....................ATGAAATTTTCTCGGGAAAATATGAAATGGGTTTTTCCA 39 .....................-M--K--F--S--R--E--N--M--K--W--V--F--P- 13 61 GAAATCAAAACAAGTCAGAATTTCCTCTCTCCTTCATCACTTCCACGACCACCACCACAA 120 40 GAAATCAAAACAAGTCAGAATTTCCTCTCTCCTTCATCACTTCCACGACCACCACCACAA 99 14 -E--I--K--T--S--Q--N--F--L--S--P--S--S--L--P--R--P--P--P--Q- 33 121 GAACCACCGTTATCTCTCCGATCCAACAACGCAAACTTCGATCTAAACAGCAAAATCAGT 180 100 GAACCACCGTTATCTCTCCGATCCAACAACGCAAACTTCGATCTAAACAGCAAAATCAGT 159 34 -E--P--P--L--S--L--R--S--N--N--A--N--F--D--L--N--S--K--I--S- 53 181 CCAAGTATTCTTCTCATAATCATAATCCTCTCAATCATCTTCTTCATCTCTGGTCTTCTT 240 160 CCAAGTATTCTTCTCATAATCATAATCCTCTCAATCATCTTCTTCATCTCTGGTCTTCTT 219 54 -P--S--I--L--L--I--I--I--I--L--S--I--I--F--F--I--S--G--L--L- 73 241 CATCTCTTAGTCAGATTCCTTCTCACACCATCAAGCAGAGACAGAGAAGATTACTTCGAC 300 220 CATCTCTTAGTCAGATTCCTTCTCACACCATCAAGCAGAGACAGAGAAGATTACTTCGAC 279 74 -H--L--L--V--R--F--L--L--T--P--S--S--R--D--R--E--D--Y--F--D- 93 301 AACGTCACTGCTCTTCAAGGCCAGCTTCAACAGCTTTTTCATCTCCATGATTCTGGAGTT 360 280 AACGTCACTGCTCTTCAAGGCCAGCTTCAACAGCTTTTTCATCTCCATGATTCTGGAGTT 339 94 -N--V--T--A--L--Q--G--Q--L--Q--Q--L--F--H--L--H--D--S--G--V- 113 361 GACCAATCCTTCATCGACACGTTACCTGTTTTCCATTACAAGTCCATAATCGGTCTCAAG 420 340 GACCAATCCTTCATCGACACGTTACCTGTTTTCCATTACAAGTCCATAATCGGTCTCAAG 399 114 -D--Q--S--F--I--D--T--L--P--V--F--H--Y--K--S--I--I--G--L--K- 133 421 AACTATCCTTTTGATTGTGCTGTTTGTCTTTGTGAGTTCGAAACAGAGGACAAGCTCAGG 480 400 AACTATCCTTTTGATTGTGCTGTTTGTCTTTGTGAGTTCGAAACAGAGGACAAGCTCAGG 459 134 -N--Y--P--F--D--C--A--V--C--L--C--E--F--E--T--E--D--K--L--R- 153 481 CTTTTACCTAAATGCAGCCACGCCTTTCACATGGATTGTATCGATACTTGGCTTCTCTCT 540 460 CTTTTACCTAAATGCAGCCACGCCTTTCACATGGATTGTATCGATACTTGGCTTCTCTCT 519 154 -L--L--P--K--C--S--H--A--F--H--M--D--C--I--D--T--W--L--L--S- 173 541 CACTCAACTTGTCCTTTGTGTAGATCTAGTCTCCTCTCTGATCTCTCTTCTCACCAAGAT 600 520 CACTCAACTTGTCCTTTGTGTAGATCTAGTCTCCTCTCTGATCTCTCTTCTCACCAAGAT 579 174 -H--S--T--C--P--L--C--R--S--S--L--L--S--D--L--S--S--H--Q--D- 193 601 CCTCGTTCTTCTTTCCTCCTTGTTCTTGAGTCTGCGAGTGATCATAGCTCCAGAGAGATT 660 580 CCTCGTTCTTCTTTCCTCCTTGTTCTTGAGTCTGCGAGTGATCATAGCTCCAGAGAGATT 639 194 -P--R--S--S--F--L--L--V--L--E--S--A--S--D--H--S--S--R--E--I- 213 661 GGAGGAGATAGAGACAGTGCAGCTTGTGTGGCTGCAAATGATGATAATGATGTGTCTAAT 720 640 GGAGGAGATAGAGACAGTGCAGCTTGTGTGGCTGCAAATGATGATAATGATGTGTCTAAT 699 214 -G--G--D--R--D--S--A--A--C--V--A--A--N--D--D--N--D--V--S--N- 233 721 GCTCATTCACATTCCAATTCTCATCTTGGTTTTGTCGGAAACAATGACCTTGGATCACAC 780 700 GCTCATTCACATTCCAATTCTCATCTTGGTTTTGTCGGAAACAATGACCTTGGATCACAC 759 234 -A--H--S--H--S--N--S--H--L--G--F--V--G--N--N--D--L--G--S--H- 253 781 CGGTTAGATTCGGGTCAAGGAGATCAATACCCGGATGGTGAATTGGGTGGTTCGGTTGGA 840 760 CGGTTAGATTCGGGTCAAGGAGATCAATACCCGGATGGTGAATTGGGTGGTTCGGTTGGA 819 254 -R--L--D--S--G--Q--G--D--Q--Y--P--D--G--E--L--G--G--S--V--G- 273 841 AAGGTTGTTCCTTTTGCAGTTAAGCTTGGGAAATTTAGGAATATAGATATTGGTGAAGGA 900 820 AAGGTTGTTCCTTTTGCAGTTAAGCTTGGGAAATTTAGGAATATAGATATTGGTGAAGGA 879 274 -K--V--V--P--F--A--V--K--L--G--K--F--R--N--I--D--I--G--E--G- 293 901 ACTAGTAGCAACAACAACATTGGTAATAGTAGTAGTTTAGATGAAAGGAGGTGTTTTTCA 960 880 ACTAGTAGCAACAACAACATTGGTAATAGTAGTAGTTTAGATGAAAGGAGGTGTTTTTCA 939 294 -T--S--S--N--N--N--I--G--N--S--S--S--L--D--E--R--R--C--F--S- 313 961 ATGGGATCATATGAGTATATAATGGATGAAGAAACGGCTCTTAAAGTTCATGTTTCAACT 1020 940 ATGGGATCATATGAGTATATAATGGATGAAGAAACGGCTCTTAAAGTTCATGTTTCAACT 999 314 -M--G--S--Y--E--Y--I--M--D--E--E--T--A--L--K--V--H--V--S--T- 333 1021 AAGAAACAATCAAGCAAGAACCGTGGCTTGCCCGGTCATAGGACCGCGATGTCCGAATGC 1080 1000 AAGAAACAATCAAGCAAGAACCGTGGCTTGCCCGGTCATAGGACCGCGATGTCCGAATGC 1059 334 -K--K--Q--S--S--K--N--R--G--L--P--G--H--R--T--A--M--S--E--C- 353 1081 GGGTTTGATCCAACAGGGAGATTGAAATTCAATGGGAGCGGATCGATGAGGATCGCGGAA 1140 1060 GGGTTTGATCCAACAGGGAGATTGAAATTCAATGGGAGCGGATCGATGAGGATCGCGGAA 1119 354 -G--F--D--P--T--G--R--L--K--F--N--G--S--G--S--M--R--I--A--E- 373 1141 GAAGCGACCGAAAAGAATGTAGTAGAAAGAGAGAGCTTTTCGGTATCGAAAATTTGGCTA 1200 1120 GAAGCGACCGAAAAGAATGTAGTAGAAAGAGAGAGCTTTTCGGTATCGAAAATTTGGCTA 1179 374 -E--A--T--E--K--N--V--V--E--R--E--S--F--S--V--S--K--I--W--L- 393 1201 AGGGGGAAGAAGGAGAAGCATAGTAAAGTTCAAGGAAAAGAAGATAGTTCATTGGTTTCG 1260 1180 AGGGGGAAGAAGGAGAAGCATAGTAAAGTTCAAGGAAAAGAAGATAGTTCATTGGTTTCG 1239 394 -R--G--K--K--E--K--H--S--K--V--Q--G--K--E--D--S--S--L--V--S- 413 1261 TCGTCTTCGGGAAGAGCATTCTCTTTCAGGTTACCGAACCAGCGTAATCCTCCCGATACG 1320 1240 TCGTCTTCGGGAAGAGCATTCTCTTTCAGGTTACCGAACCAGCGTAATCCTCCCGATACG 1299 414 -S--S--S--G--R--A--F--S--F--R--L--P--N--Q--R--N--P--P--D--T- 433 1321 AAGAATGAGAGTGGCTGCGAAGAAGAGAATCAAAAGTGCGAAAACTCGGAATCTTTGGAG 1380 1300 AAGAATGAGAGTGGCTGCGAAGAAGAGAATCAAAAGTGCGAAAACTCGGAATCTTTGGAG 1359 434 -K--N--E--S--G--C--E--E--E--N--Q--K--C--E--N--S--E--S--L--E- 453 1381 ACTAAAACACCATCTTTTGCTAGGAGGACTATGCTTTGGCTTGCAGGGAGACAAAACAAG 1440 1360 ACTAAAACACCATCTTTTGCTAGGAGGACTATGCTTTGGCTTGCAGGGAGACAAAACAAG 1419 454 -T--K--T--P--S--F--A--R--R--T--M--L--W--L--A--G--R--Q--N--K- 473 1441 GTTGTTCATTCTTCTTCTTCAACTAATGTCTAGTTTCTCTATTTTTCCTTTTCA 1494 1420 GTTGTTCATTCTTCTTCTTCAACTAATGTCTAG..................... 1452 474 -V--V--H--S--S--S--S--T--N--V--*-..................... 483
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