Arabidopsis lyrata (v.1.0)
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Hypoxia-responsive family protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:D7LRI1]

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This transcript has 3 exons and is annotated with 17 domains and features.

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-scaffold_501742.11141366aa
 
Protein coding
D7LRI1 Ensembl Canonical
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     1 TAAAGCTGCTGCTGGAGAAGATGAGTGCGGTAGAACCAGACATGGAAGATCTGTTCCAGG     60
       ....................ATGAGTGCGGTAGAACCAGACATGGAAGATCTGTTCCAGG     40
       ....................-M--S--A--V--E--P--D--M--E--D--L--F--Q--     13

                                                                          
    61 AGAAGAAGCGTGTCAGGAATCCTCTCGTTCCTCTCGGTGCACTTATGACTGCCGGAGTGC    120
    41 AGAAGAAGCGTGTCAGGAATCCTCTCGTTCCTCTCGGTGCACTTATGACTGCCGGAGTGC    100
    14 E--K--K--R--V--R--N--P--L--V--P--L--G--A--L--M--T--A--G--V--     33

                                                                          
   121 TTACGGCTGGGCTGATTAGTTTCAGAAGAGGCAATTCTCAGTTGGGTCAGGTTTTGATGA    180
   101 TTACGGCTGGGCTGATTAGTTTCAGAAGAGGCAATTCTCAGTTGGGTCAGGTTTTGATGA    160
    34 L--T--A--G--L--I--S--F--R--R--G--N--S--Q--L--G--Q--V--L--M--     53

                                                                          
   181 GAGCTAGAGTGGTCGTCCAGGGTGCTACTGTCGCTTTAATGGTCGGAACCGCTTATTACT    240
   161 GAGCTAGAGTGGTCGTCCAGGGTGCTACTGTCGCTTTAATGGTCGGAACCGCTTATTACT    220
    54 R--A--R--V--V--V--Q--G--A--T--V--A--L--M--V--G--T--A--Y--Y--     73

                                                                          
   241 ACGGTGATAATCCGTTACTTTTGTCTGAAATCCATGAAACAGAAGCTCTTTCACCTAAAT    300
   221 ACGGTGATAATCCGTTACTTTTGTCTGAAATCCATGAAACAGAAGCTCTTTCACCTAAAT    280
    74 Y--G--D--N--P--L--L--L--S--E--I--H--E--T--E--A--L--S--P--K--     93

                                                                          
   301 CTTCATCTGCAGCAACTATTACTCTTATGAACCAGAAAGATCCATCTTCAAGCTCTATAG    360
   281 CTTCATCTGCAGCAACTATTACTCTTATGAACCAGAAAGATCCATCTTCAAGCTCTATAG    340
    94 S--S--S--A--A--T--I--T--L--M--N--Q--K--D--P--S--S--S--S--I--    113

                                                                          
   361 TCTCTGTTTTATGTTTAGTTATCTCTGTTCTTGCTCTTATCATCGTCTTCCTAGGTGTCC    420
   341 TCTCTGTTTTATGTTTAGTTATCTCTGTTCTTGCTCTTATCATCGTCTTCCTAGGTGTCC    400
   114 V--S--V--L--C--L--V--I--S--V--L--A--L--I--I--V--F--L--G--V--    133

                                                                          
   421 TCTACTTAATCTTCAAATTTCTCCGCAAGTCCTCGACTTTATTTCCCATTCCCCATTTCA    480
   401 TCTACTTAATCTTCAAATTTCTCCGCAAGTCCTCGACTTTATTTCCCATTCCCCATTTCA    460
   134 L--Y--L--I--F--K--F--L--R--K--S--S--T--L--F--P--I--P--H--F--    153

                                                                          
   481 ATCCCAACCCAGATCTCTCTTCTTCCTCCTCTCCTCAGCTCCAGCACCTCTTCTTCCTCC    540
   461 ATCCCAACCCAGATCTCTCTTCTTCCTCCTCTCCTCAGCTCCAGCACCTCTTCTTCCTCC    520
   154 N--P--N--P--D--L--S--S--S--S--S--P--Q--L--Q--H--L--F--F--L--    173

                                                                          
   541 ATGACTCTGGTCTAGACCAGACCTCCATTGATGCACTTCCCGTGTTCCTCTATGGTAACG    600
   521 ATGACTCTGGTCTAGACCAGACCTCCATTGATGCACTTCCCGTGTTCCTCTATGGTAACG    580
   174 H--D--S--G--L--D--Q--T--S--I--D--A--L--P--V--F--L--Y--G--N--    193

                                                                          
   601 TAACCATGAGTCTGAAAGAGTCTTTCGATTGCGCTGTATGTCTCAATGAGTTCTCTGACA    660
   581 TAACCATGAGTCTGAAAGAGTCTTTCGATTGCGCTGTATGTCTCAATGAGTTCTCTGACA    640
   194 V--T--M--S--L--K--E--S--F--D--C--A--V--C--L--N--E--F--S--D--    213

                                                                          
   661 CAGACAAGCTCAGGCTACTCCCAGTCTGTAGCCACGCATTCCATCTTCACTGTATCGACA    720
   641 CAGACAAGCTCAGGCTACTCCCAGTCTGTAGCCACGCATTCCATCTTCACTGTATCGACA    700
   214 T--D--K--L--R--L--L--P--V--C--S--H--A--F--H--L--H--C--I--D--    233

                                                                          
   721 CATGGCTTCTCTCCAACTCTACTTGCCCTCTCTGCAGACGATCACTCTCAACCTCAAACG    780
   701 CATGGCTTCTCTCCAACTCTACTTGCCCTCTCTGCAGACGATCACTCTCAACCTCAAACG    760
   234 T--W--L--L--S--N--S--T--C--P--L--C--R--R--S--L--S--T--S--N--    253

                                                                          
   781 TCTGCTATAACCATGCTGAGGCTCTTGTCGTCCCCTTGTCCGGGCATCAGCAGGTCGACG    840
   761 TCTGCTATAACCATGCTGAGGCTCTTGTCGTCCCCTTGTCCGGGCATCAGCAGGTCGACG    820
   254 V--C--Y--N--H--A--E--A--L--V--V--P--L--S--G--H--Q--Q--V--D--    273

                                                                          
   841 AAGGCAAATCCTCCCTTGCTAAAAGAGTCTTTTCTGTTCGTCTTGGGAGATTCAAAAGCA    900
   821 AAGGCAAATCCTCCCTTGCTAAAAGAGTCTTTTCTGTTCGTCTTGGGAGATTCAAAAGCA    880
   274 E--G--K--S--S--L--A--K--R--V--F--S--V--R--L--G--R--F--K--S--    293

                                                                          
   901 CGAACGAAAGTCAAAGTCAACGACACGATGTCAAAGATGAAATTGGTGTAGGAATGCCAA    960
   881 CGAACGAAAGTCAAAGTCAACGACACGATGTCAAAGATGAAATTGGTGTAGGAATGCCAA    940
   294 T--N--E--S--Q--S--Q--R--H--D--V--K--D--E--I--G--V--G--M--P--    313

                                                                          
   961 GAAGGTGTTACTCGATGGGCACGCAACAGTATCTCGAATGCGATCAAGATTTTGTGGTGG   1020
   941 GAAGGTGTTACTCGATGGGCACGCAACAGTATCTCGAATGCGATCAAGATTTTGTGGTGG   1000
   314 R--R--C--Y--S--M--G--T--Q--Q--Y--L--E--C--D--Q--D--F--V--V--    333

                                                                          
  1021 CTCTGTCTTCGTCTCCTCGTGAGGGAAATACCGGTAATAACTGCTCCATTCACGAGGGTG   1080
  1001 CTCTGTCTTCGTCTCCTCGTGAGGGAAATACCGGTAATAACTGCTCCATTCACGAGGGTG   1060
   334 A--L--S--S--S--P--R--E--G--N--T--G--N--N--C--S--I--H--E--G--    353

                                                                          
  1081 ATTCGGTAAAACAAGACTCTGGTGGTTTGGGTAGGCACTAATGTATTGTAGTAGGAAAGA   1140
  1061 ATTCGGTAAAACAAGACTCTGGTGGTTTGGGTAGGCACTAA...................   1101
   354 D--S--V--K--Q--D--S--G--G--L--G--R--H--*-...................    366

                                                                          
  1141 G                                                              1141
       .                                                                  
       .