Transcript: scaffold_501742.1
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Description
Hypoxia-responsive family protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:D7LRI1 ]
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- scaffold_501742.1 1141 366aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
D7LRI1 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 TAAAGCTGCTGCTGGAGAAG ATG AGT GCG GTA GAA CCA GAC ATG GAA GAT CTG TTC CAG G 60
....................ATGAGTGCGGTAGAACCAGACATGGAAGATCTGTTCCAGG 40
....................-M--S--A--V--E--P--D--M--E--D--L--F--Q-- 13
61 AG AAG AAG CGT GTC AGG AAT CCT CTC GTT CCT CTC G G T GCA CTT ATG ACT GCC GGA GTG C 120
41 AGAAGAAGCGTGTCAGGAATCCTCTCGTTCCTCTCGGTGCACTTATGACTGCCGGAGTGC 100
14 E--K--K--R--V--R--N--P--L--V--P--L--G--A--L--M--T--A--G--V-- 33
121 TT ACG GCT GGG CTG ATT AGT TTC AGA AGA GGC AAT TCT CAG TTG GGT CAG GTT TTG ATG A 180
101 TTACGGCTGGGCTGATTAGTTTCAGAAGAGGCAATTCTCAGTTGGGTCAGGTTTTGATGA 160
34 L--T--A--G--L--I--S--F--R--R--G--N--S--Q--L--G--Q--V--L--M-- 53
181 GA GCT AGA GTG GTC GTC CAG GGT GCT ACT GTC GCT TTA ATG GTC GGA ACC GCT TAT TAC T 240
161 GAGCTAGAGTGGTCGTCCAGGGTGCTACTGTCGCTTTAATGGTCGGAACCGCTTATTACT 220
54 R--A--R--V--V--V--Q--G--A--T--V--A--L--M--V--G--T--A--Y--Y-- 73
241 AC GGT GAT AAT CC G TTA CTT TTG TCT GAA ATC CAT GAA ACA GAA GCT CTT TCA CCT AAA T 300
221 ACGGTGATAATCCGTTACTTTTGTCTGAAATCCATGAAACAGAAGCTCTTTCACCTAAAT 280
74 Y--G--D--N--P--L--L--L--S--E--I--H--E--T--E--A--L--S--P--K-- 93
301 CT TCA TCT GCA GCA ACT ATT ACT CTT ATG AAC CAG AAA GAT CCA TCT TCA AGC TCT ATA G 360
281 CTTCATCTGCAGCAACTATTACTCTTATGAACCAGAAAGATCCATCTTCAAGCTCTATAG 340
94 S--S--S--A--A--T--I--T--L--M--N--Q--K--D--P--S--S--S--S--I-- 113
361 TC TCT GTT TTA TGT TTA GTT ATC TCT GTT CTT GCT CTT ATC ATC GTC TTC CTA GGT GTC C 420
341 TCTCTGTTTTATGTTTAGTTATCTCTGTTCTTGCTCTTATCATCGTCTTCCTAGGTGTCC 400
114 V--S--V--L--C--L--V--I--S--V--L--A--L--I--I--V--F--L--G--V-- 133
421 TC TAC TTA ATC TTC AAA TTT CTC CGC AAG TCC TCG ACT TTA TTT CCC ATT CCC CAT TTC A 480
401 TCTACTTAATCTTCAAATTTCTCCGCAAGTCCTCGACTTTATTTCCCATTCCCCATTTCA 460
134 L--Y--L--I--F--K--F--L--R--K--S--S--T--L--F--P--I--P--H--F-- 153
481 AT CCC AAC CCA GAT CTC TCT TCT TCC TCC TCT CCT CAG CTC CAG CAC CTC TTC TTC CTC C 540
461 ATCCCAACCCAGATCTCTCTTCTTCCTCCTCTCCTCAGCTCCAGCACCTCTTCTTCCTCC 520
154 N--P--N--P--D--L--S--S--S--S--S--P--Q--L--Q--H--L--F--F--L-- 173
541 AT GAC TCT GGT CTA GAC CAG ACC TCC ATT GAT GCA CTT CCC GTG TTC CTC TAT GGT AAC G 600
521 ATGACTCTGGTCTAGACCAGACCTCCATTGATGCACTTCCCGTGTTCCTCTATGGTAACG 580
174 H--D--S--G--L--D--Q--T--S--I--D--A--L--P--V--F--L--Y--G--N-- 193
601 TA ACC ATG AGT CTG AAA GAG TCT TTC GAT TGC GCT GTA TGT CTC AAT GAG TTC TCT GAC A 660
581 TAACCATGAGTCTGAAAGAGTCTTTCGATTGCGCTGTATGTCTCAATGAGTTCTCTGACA 640
194 V--T--M--S--L--K--E--S--F--D--C--A--V--C--L--N--E--F--S--D-- 213
661 CA GAC AAG CTC AGG CTA CTC CCA GTC TGT AGC CAC GCA TTC CAT CTT CAC TGT ATC GAC A 720
641 CAGACAAGCTCAGGCTACTCCCAGTCTGTAGCCACGCATTCCATCTTCACTGTATCGACA 700
214 T--D--K--L--R--L--L--P--V--C--S--H--A--F--H--L--H--C--I--D-- 233
721 CA TGG CTT CTC TCC AAC TCT ACT TGC CCT CTC TGC AGA CGA TCA CTC TCA ACC TCA AAC G 780
701 CATGGCTTCTCTCCAACTCTACTTGCCCTCTCTGCAGACGATCACTCTCAACCTCAAACG 760
234 T--W--L--L--S--N--S--T--C--P--L--C--R--R--S--L--S--T--S--N-- 253
781 TC TGC TAT AAC CAT GCT GAG GCT CTT GTC GTC CCC TTG TCC GGG CAT CAG CAG GTC GAC G 840
761 TCTGCTATAACCATGCTGAGGCTCTTGTCGTCCCCTTGTCCGGGCATCAGCAGGTCGACG 820
254 V--C--Y--N--H--A--E--A--L--V--V--P--L--S--G--H--Q--Q--V--D-- 273
841 AA GGC AAA TCC TCC CTT GCT AAA AGA GTC TTT TCT GTT CGT CTT GGG AGA TTC AAA AGC A 900
821 AAGGCAAATCCTCCCTTGCTAAAAGAGTCTTTTCTGTTCGTCTTGGGAGATTCAAAAGCA 880
274 E--G--K--S--S--L--A--K--R--V--F--S--V--R--L--G--R--F--K--S-- 293
901 CG AAC GAA AGT CAA AGT CAA CGA CAC GAT GTC AAA GAT GAA ATT GGT GTA GGA ATG CCA A 960
881 CGAACGAAAGTCAAAGTCAACGACACGATGTCAAAGATGAAATTGGTGTAGGAATGCCAA 940
294 T--N--E--S--Q--S--Q--R--H--D--V--K--D--E--I--G--V--G--M--P-- 313
961 GA AGG TGT TAC TCG ATG GGC ACG CAA CAG TAT CTC GAA TGC GAT CAA GAT TTT GTG GTG G 1020
941 GAAGGTGTTACTCGATGGGCACGCAACAGTATCTCGAATGCGATCAAGATTTTGTGGTGG 1000
314 R--R--C--Y--S--M--G--T--Q--Q--Y--L--E--C--D--Q--D--F--V--V-- 333
1021 CT CTG TCT TCG TCT CCT CGT GAG GGA AAT ACC GGT AAT AAC TGC TCC ATT CAC GAG GGT G 1080
1001 CTCTGTCTTCGTCTCCTCGTGAGGGAAATACCGGTAATAACTGCTCCATTCACGAGGGTG 1060
334 A--L--S--S--S--P--R--E--G--N--T--G--N--N--C--S--I--H--E--G-- 353
1081 AT TCG GTA AAA CAA GAC TCT GGT GGT TTG GGT AGG CAC TAA TGTATTGTAGTAGGAAAGA 1140
1061 ATTCGGTAAAACAAGACTCTGGTGGTTTGGGTAGGCACTAA................... 1101
354 D--S--V--K--Q--D--S--G--G--L--G--R--H--*-................... 366
1141 G 1141
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