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Arabidopsis lyrata (v.1.0)
Description

Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH5 [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT2G35160) UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O82175]

Location
About this transcript

This transcript has 1 exon and is annotated with 24 domains and features.

Gene
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
-scaffold_402114.12449802aa
 
Protein coding
D7LHT0 -Ensembl Canonical
Codons
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  • Alternating codons
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     1 TTGAGTAGGAATTGGACAACATGGTACATTCAGAGTCATCAAAACTCATTTCGTTGCGCG     60
       ....................ATGGTACATTCAGAGTCATCAAAACTCATTTCGTTGCGCG     40
       ....................-M--V--H--S--E--S--S--K--L--I--S--L--R--     13

                                                                          
    61 GTGGTAGTGGTCCTTTTTCTAAGGATGAACTGGCAACAAATGGTAGTTATACCGATCCTA    120
    41 GTGGTAGTGGTCCTTTTTCTAAGGATGAACTGGCAACAAATGGTAGTTATACCGATCCTA    100
    14 G--G--S--G--P--F--S--K--D--E--L--A--T--N--G--S--Y--T--D--P--     33

                                                                          
   121 TGGGGCGGAGGAAGTCCAAGCGGTTTAAGGTTGCAGCGGAAAGTGAGTTTTCTCCTGATT    180
   101 TGGGGCGGAGGAAGTCCAAGCGGTTTAAGGTTGCAGCGGAAAGTGAGTTTTCTCCTGATT    160
    34 M--G--R--R--K--S--K--R--F--K--V--A--A--E--S--E--F--S--P--D--     53

                                                                          
   181 GTGGATCGGGTTCCATGCGGCTCAGATCAAGAACTATACAGAAGGAGGTCCAAATTGAGA    240
   161 GTGGATCGGGTTCCATGCGGCTCAGATCAAGAACTATACAGAAGGAGGTCCAAATTGAGA    220
    54 C--G--S--G--S--M--R--L--R--S--R--T--I--Q--K--E--V--Q--I--E--     73

                                                                          
   241 CTTGCGAGAACAAGAATGCTTCTGAGGTTGAGGTTGAGTTGATTCCTGGAGAAAAAGTGG    300
   221 CTTGCGAGAACAAGAATGCTTCTGAGGTTGAGGTTGAGTTGATTCCTGGAGAAAAAGTGG    280
    74 T--C--E--N--K--N--A--S--E--V--E--V--E--L--I--P--G--E--K--V--     93

                                                                          
   301 CAGATCGAGATGGTTTTAAATCCGTTGATTGTAATGACATGTCGGCTGGAGGAACCGAAG    360
   281 CAGATCGAGATGGTTTTAAATCCGTTGATTGTAATGACATGTCGGCTGGAGGAACCGAAG    340
    94 A--D--R--D--G--F--K--S--V--D--C--N--D--M--S--A--G--G--T--E--    113

                                                                          
   361 GAGCTAAATCTCTTCGAGTTAATATGCAAGAACCAATGGAAGGTAGGAATCTGCCAGAGA    420
   341 GAGCTAAATCTCTTCGAGTTAATATGCAAGAACCAATGGAAGGTAGGAATCTGCCAGAGA    400
   114 G--A--K--S--L--R--V--N--M--Q--E--P--M--E--G--R--N--L--P--E--    133

                                                                          
   421 ATACAAGTGAGCAAAATTTGGTGGAGGTCCATCCTCCAAGCATTAGCCTGCCAGAAGAAG    480
   401 ATACAAGTGAGCAAAATTTGGTGGAGGTCCATCCTCCAAGCATTAGCCTGCCAGAAGAAG    460
   134 N--T--S--E--Q--N--L--V--E--V--H--P--P--S--I--S--L--P--E--E--    153

                                                                          
   481 ATGTGGTGGGGTCTGTTTGCAGGAAAAGCATCACCGGGACAAAGGAGCTTCGCGGAAGAA    540
   461 ATGTGGTGGGGTCTGTTTGCAGGAAAAGCATCACCGGGACAAAGGAGCTTCGCGGAAGAA    520
   154 D--V--V--G--S--V--C--R--K--S--I--T--G--T--K--E--L--R--G--R--    173

                                                                          
   541 CGGTTTCTGTAGTGAGAGACTTATCTCCAAATATGGGGAGCAAGTTTTCAAAGAGTGGAA    600
   521 CGGTTTCTGTAGTGAGAGACTTATCTCCAAATATGGGGAGCAAGTTTTCAAAGAGTGGAA    580
   174 T--V--S--V--V--R--D--L--S--P--N--M--G--S--K--F--S--K--S--G--    193

                                                                          
   601 AGACCGCTAAAGGTTCTATATCGATGGAAGAGGATAACTTGGTTCTGGAAAAGTCAGATT    660
   581 AGACCGCTAAAGGTTCTATATCGATGGAAGAGGATAACTTGGTTCTGGAAAAGTCAGATT    640
   194 K--T--A--K--G--S--I--S--M--E--E--D--N--L--V--L--E--K--S--D--    213

                                                                          
   661 CTGGAGATCATTTGGGTCAATCTCTTTCTAAAAGCATATCACCAGAGGTTTTGGAACTTG    720
   641 CTGGAGATCATTTGGGTCAATCTCTTTCTAAAAGCATATCACCAGAGGTTTTGGAACTTG    700
   214 S--G--D--H--L--G--Q--S--L--S--K--S--I--S--P--E--V--L--E--L--    233

                                                                          
   721 ATAAATCAAAGGTTACTGTTCCAAAACCAATTGAGGCTGCTGTTAGGATAATTACAAACA    780
   701 ATAAATCAAAGGTTACTGTTCCAAAACCAATTGAGGCTGCTGTTAGGATAATTACAAACA    760
   234 D--K--S--K--V--T--V--P--K--P--I--E--A--A--V--R--I--I--T--N--    253

                                                                          
   781 AAGGGGTTGCAATGCCTCCACCCTTGAAGCCTTCCGAGAAGACGAATGGAGATTATGGTG    840
   761 AAGGGGTTGCAATGCCTCCACCCTTGAAGCCTTCCGAGAAGACGAATGGAGATTATGGTG    820
   254 K--G--V--A--M--P--P--P--L--K--P--S--E--K--T--N--G--D--Y--G--    273

                                                                          
   841 AAGGATCTATGAGGAAGAATAGTGAGAGGGTTGCCCCGGATAAAAAGAGATTAGCTCGTA    900
   821 AAGGATCTATGAGGAAGAATAGTGAGAGGGTTGCCCCGGATAAAAAGAGATTAGCTCGTA    880
   274 E--G--S--M--R--K--N--S--E--R--V--A--P--D--K--K--R--L--A--R--    293

                                                                          
   901 ATCCTCGGTTATCAAATGGTGGGCTTCCTAGTGGCTCAAGCAGTGGGGAAAGTGCTCGGT    960
   881 ATCCTCGGTTATCAAATGGTGGGCTTCCTAGTGGCTCAAGCAGTGGGGAAAGTGCTCGGT    940
   294 N--P--R--L--S--N--G--G--L--P--S--G--S--S--S--G--E--S--A--R--    313

                                                                          
   961 ACAAAGTTAAGGAAACTCTGCGTCTTTTCCATGAAACTTGTAAAAAAATTATGCAGGAGG   1020
   941 ACAAAGTTAAGGAAACTCTGCGTCTTTTCCATGAAACTTGTAAAAAAATTATGCAGGAGG   1000
   314 Y--K--V--K--E--T--L--R--L--F--H--E--T--C--K--K--I--M--Q--E--    333

                                                                          
  1021 AAGAAGCAAGGCCTAGGAAAAGAGATGGTAGCAAGTTCAGAGTGGATAACGAGGCTTCGA   1080
  1001 AAGAAGCAAGGCCTAGGAAAAGAGATGGTAGCAAGTTCAGAGTGGATAACGAGGCTTCGA   1060
   334 E--E--A--R--P--R--K--R--D--G--S--K--F--R--V--D--N--E--A--S--    353

                                                                          
  1081 AAATTCTCAAGGGTAAAGGGAAAAATCTTAACAGTGGTACTCAGATTATTGGAACCGTGC   1140
  1061 AAATTCTCAAGGGTAAAGGGAAAAATCTTAACAGTGGTACTCAGATTATTGGAACCGTGC   1120
   354 K--I--L--K--G--K--G--K--N--L--N--S--G--T--Q--I--I--G--T--V--    373

                                                                          
  1141 CTGGTGTTGAGGTTGGCGATGAATTTCAATATAGAATGGAGATGAACTTTCTTGGTATAC   1200
  1121 CTGGTGTTGAGGTTGGCGATGAATTTCAATATAGAATGGAGATGAACTTTCTTGGTATAC   1180
   374 P--G--V--E--V--G--D--E--F--Q--Y--R--M--E--M--N--F--L--G--I--    393

                                                                          
  1201 ATAGACCAAGTCAAAGTGGTATCGATTATATGAAAGATGACGGCGAGGAACTAGTTGCCA   1260
  1181 ATAGACCAAGTCAAAGTGGTATCGATTATATGAAAGATGACGGCGAGGAACTAGTTGCCA   1240
   394 H--R--P--S--Q--S--G--I--D--Y--M--K--D--D--G--E--E--L--V--A--    413

                                                                          
  1261 CGAGTATTGTATCCTCTGGAGGTTATGATGACGTGGTTGATAACTCGGATGTCTTGATCT   1320
  1241 CGAGTATTGTATCCTCTGGAGGTTATGATGACGTGGTTGATAACTCGGATGTCTTGATCT   1300
   414 T--S--I--V--S--S--G--G--Y--D--D--V--V--D--N--S--D--V--L--I--    433

                                                                          
  1321 ACACGGGTCAAGGCGGAAATGTGGGGAAAAAGGGAAAGAAAAATAATGAACCCAAAGACC   1380
  1301 ACACGGGTCAAGGCGGAAATGTGGGGAAAAAGGGAAAGAAAAATAATGAACCCAAAGACC   1360
   434 Y--T--G--Q--G--G--N--V--G--K--K--G--K--K--N--N--E--P--K--D--    453

                                                                          
  1381 AACAGCTTGTAACGGGAAACCTTGCGTTGAAAAACAGTATACACAAAAAGAACCCTGTGC   1440
  1361 AACAGCTTGTAACGGGAAACCTTGCGTTGAAAAACAGTATACACAAAAAGAACCCTGTGC   1420
   454 Q--Q--L--V--T--G--N--L--A--L--K--N--S--I--H--K--K--N--P--V--    473

                                                                          
  1441 GGGTCATAAGAGGCATTAAAAATACGACACTACAATCATCAGCTGTTGCAAAGAATTATG   1500
  1421 GGGTCATAAGAGGCATTAAAAATACGACACTACAATCATCAGCTGTTGCAAAGAATTATG   1480
   474 R--V--I--R--G--I--K--N--T--T--L--Q--S--S--A--V--A--K--N--Y--    493

                                                                          
  1501 TTTACGATGGATTGTATCTGGTGGAAGAGTACTGGGATGAAACTGGGTCTCACGGTAAGC   1560
  1481 TTTACGATGGATTGTATCTGGTGGAAGAGTACTGGGATGAAACTGGGTCTCACGGTAAGC   1540
   494 V--Y--D--G--L--Y--L--V--E--E--Y--W--D--E--T--G--S--H--G--K--    513

                                                                          
  1561 TCGTCTTCAAGTTCAAACTGCGGCGTATTCCTGGACAACCCGAGCTTCCCTGGAAAGTGG   1620
  1541 TCGTCTTCAAGTTCAAACTGCGGCGTATTCCTGGACAACCCGAGCTTCCCTGGAAAGTGG   1600
   514 L--V--F--K--F--K--L--R--R--I--P--G--Q--P--E--L--P--W--K--V--    533

                                                                          
  1621 TTGAGAAATCGAAGAAATCCGAGTTCCGGGACGGTCTTTGCAATGTTGATATCTCAGAAG   1680
  1601 TTGAGAAATCGAAGAAATCCGAGTTCCGGGACGGTCTTTGCAATGTTGATATCTCAGAAG   1660
   534 V--E--K--S--K--K--S--E--F--R--D--G--L--C--N--V--D--I--S--E--    553

                                                                          
  1681 GGAAAGAGACATTACCCATATGCGCTGTGAACAATATAGATGATGAGAAACCAGCTCCGT   1740
  1661 GGAAAGAGACATTACCCATATGCGCTGTGAACAATATAGATGATGAGAAACCAGCTCCGT   1720
   554 G--K--E--T--L--P--I--C--A--V--N--N--I--D--D--E--K--P--A--P--    573

                                                                          
  1741 TTATCTACACGGTTAAAATGATATATCCGGATTGGTGCCGGCCAATTCCTCCAAAGAGCT   1800
  1721 TTATCTACACGGTTAAAATGATATATCCGGATTGGTGCCGGCCAATTCCTCCAAAGAGCT   1780
   574 F--I--Y--T--V--K--M--I--Y--P--D--W--C--R--P--I--P--P--K--S--    593

                                                                          
  1801 GTGGTTGCACAAAACGCTGCTCCGAATCAAAAAAGTGTGCATGCGTTGTGAAAAACGGTG   1860
  1781 GTGGTTGCACAAAACGCTGCTCCGAATCAAAAAAGTGTGCATGCGTTGTGAAAAACGGTG   1840
   594 C--G--C--T--K--R--C--S--E--S--K--K--C--A--C--V--V--K--N--G--    613

                                                                          
  1861 GAGAGATACCGTACAATTATGATGGAGCCATTGTTAGTATAAAGCCCCTGGTCTATGAGT   1920
  1841 GAGAGATACCGTACAATTATGATGGAGCCATTGTTAGTATAAAGCCCCTGGTCTATGAGT   1900
   614 G--E--I--P--Y--N--Y--D--G--A--I--V--S--I--K--P--L--V--Y--E--    633

                                                                          
  1921 GTGGCCCACACTGCCAATGCCCACCTTCTTGCTACATGAGAGTCTCACAGCACGGGATCA   1980
  1901 GTGGCCCACACTGCCAATGCCCACCTTCTTGCTACATGAGAGTCTCACAGCACGGGATCA   1960
   634 C--G--P--H--C--Q--C--P--P--S--C--Y--M--R--V--S--Q--H--G--I--    653

                                                                          
  1981 AGATCAAGCTGGAGATCTTCAAAACGGAGTCAAGAGGATGGGGAGTGAGATCGCTGGAAT   2040
  1961 AGATCAAGCTGGAGATCTTCAAAACGGAGTCAAGAGGATGGGGAGTGAGATCGCTGGAAT   2020
   654 K--I--K--L--E--I--F--K--T--E--S--R--G--W--G--V--R--S--L--E--    673

                                                                          
  2041 CTATTCCTATCGGAAGCTTTATCTGTGAGTACGCAGGAGAGCTTCTAGAGGATAAACAAG   2100
  2021 CTATTCCTATCGGAAGCTTTATCTGTGAGTACGCAGGAGAGCTTCTAGAGGATAAACAAG   2080
   674 S--I--P--I--G--S--F--I--C--E--Y--A--G--E--L--L--E--D--K--Q--    693

                                                                          
  2101 CAGAAAGACTTACCGGGAAAGATGAGTATCTCTTTGAACTCGGGGAGGAGGAGGATCAGT   2160
  2081 CAGAAAGACTTACCGGGAAAGATGAGTATCTCTTTGAACTCGGGGAGGAGGAGGATCAGT   2140
   694 A--E--R--L--T--G--K--D--E--Y--L--F--E--L--G--E--E--E--D--Q--    713

                                                                          
  2161 TCACCATAGACGCAGCACGGAAAGGGAACATAGGGAGGTTTATAAACCATAGCTGCTCAC   2220
  2141 TCACCATAGACGCAGCACGGAAAGGGAACATAGGGAGGTTTATAAACCATAGCTGCTCAC   2200
   714 F--T--I--D--A--A--R--K--G--N--I--G--R--F--I--N--H--S--C--S--    733

                                                                          
  2221 CGAATCTGTACGCACAGGACGTATTGTACGACCATGAGGACACAAGAATACCTCACATTA   2280
  2201 CGAATCTGTACGCACAGGACGTATTGTACGACCATGAGGACACAAGAATACCTCACATTA   2260
   734 P--N--L--Y--A--Q--D--V--L--Y--D--H--E--D--T--R--I--P--H--I--    753

                                                                          
  2281 TGTTCTTTGCACTGGACCATATACCTCCACTTGAGGAACTCTCATACGACTACAATTATA   2340
  2261 TGTTCTTTGCACTGGACCATATACCTCCACTTGAGGAACTCTCATACGACTACAATTATA   2320
   754 M--F--F--A--L--D--H--I--P--P--L--E--E--L--S--Y--D--Y--N--Y--    773

                                                                          
  2341 AGATCGATCAGGTAACCGACTCTAATGGTAATATCAAGAAGAAAATTTGCTACTGTGGTT   2400
  2321 AGATCGATCAGGTAACCGACTCTAATGGTAATATCAAGAAGAAAATTTGCTACTGTGGTT   2380
   774 K--I--D--Q--V--T--D--S--N--G--N--I--K--K--K--I--C--Y--C--G--    793

                                                                          
  2401 CCGCTGAGTGTAGTGGTAGGCTCTACTAAGTAAGCTGTTGTTACCCCTT              2449
  2381 CCGCTGAGTGTAGTGGTAGGCTCTACTAA....................              2409
   794 S--A--E--C--S--G--R--L--Y--*-....................               802