Hordeum vulgare ZDM02064 (Hvulgare_cv_Chiba_ZDM02064_BPGv2) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesGeneral identifiersOligo probesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
Primary_assembly OX460069.1: 511,479,694-511,482,847 reverse strand.
This transcript has 1 exon and is annotated with 12 domains and features.
This transcript is a product of gene HORVU.ZDM02064.PROJ.2HG00155390 Show transcript tableHide transcript table
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1 AACCGATGCCGCCTTCTCGTTCTCCTCTGACCCTGAAGAACCTGGGCCTCCTCTACCGCT 60 .....ATGCCGCCTTCTCGTTCTCCTCTGACCCTGAAGAACCTGGGCCTCCTCTACCGCT 55 .....-M--P--P--S--R--S--P--L--T--L--K--N--L--G--L--L--Y--R-- 18 61 TCCTAGCCTCGCCGTCGTCGCCGCCTCCGCCGCTGCCCGTGCTCCTCCGCCTGCACGCTC 120 56 TCCTAGCCTCGCCGTCGTCGCCGCCTCCGCCGCTGCCCGTGCTCCTCCGCCTGCACGCTC 115 19 F--L--A--S--P--S--S--P--P--P--P--L--P--V--L--L--R--L--H--A-- 38 121 TCGCTGCCACCTCGGGCCTCTGTTTCCGCCCCGACTTCGCCGCCAAGCTCGTCTCCGCCT 180 116 TCGCTGCCACCTCGGGCCTCTGTTTCCGCCCCGACTTCGCCGCCAAGCTCGTCTCCGCCT 175 39 L--A--A--T--S--G--L--C--F--R--P--D--F--A--A--K--L--V--S--A-- 58 181 ACTCCTCCTCCGGCCACCCCGGCCTCGCCGCCCTCGCCTTCTCCGCCTCCCCCTGTCCCG 240 176 ACTCCTCCTCCGGCCACCCCGGCCTCGCCGCCCTCGCCTTCTCCGCCTCCCCCTGTCCCG 235 59 Y--S--S--S--G--H--P--G--L--A--A--L--A--F--S--A--S--P--C--P-- 78 241 ACACCTTCCTCTGGAACTCCCTCCTCCGCTCCCACCATTGCGCCTCCGAATTCGCCTCCG 300 236 ACACCTTCCTCTGGAACTCCCTCCTCCGCTCCCACCATTGCGCCTCCGAATTCGCCTCCG 295 79 D--T--F--L--W--N--S--L--L--R--S--H--H--C--A--S--E--F--A--S-- 98 301 CGCTCTCCGCCCACCGCCGCATGTGCGCCTCTGGCGCGCGGCCTTCCCGGTTCACCGCCC 360 296 CGCTCTCCGCCCACCGCCGCATGTGCGCCTCTGGCGCGCGGCCTTCCCGGTTCACCGCCC 355 99 A--L--S--A--H--R--R--M--C--A--S--G--A--R--P--S--R--F--T--A-- 118 361 CCATCGCCGCCTCTGCGGCCGCAGAGCTCGCGGTCCTCCCGGTCGGCTCCTCCGTGCACG 420 356 CCATCGCCGCCTCTGCGGCCGCAGAGCTCGCGGTCCTCCCGGTCGGCTCCTCCGTGCACG 415 119 P--I--A--A--S--A--A--A--E--L--A--V--L--P--V--G--S--S--V--H-- 138 421 CCTACTCCGTCAAGCTCGGCCTCCTGGTAGGCGACGGTTCCATCGCCGTCTCGTCGTCGC 480 416 CCTACTCCGTCAAGCTCGGCCTCCTGGTAGGCGACGGTTCCATCGCCGTCTCGTCGTCGC 475 139 A--Y--S--V--K--L--G--L--L--V--G--D--G--S--I--A--V--S--S--S-- 158 481 TGGTGTACATGTATGCCAGGTGTGTCCGCATTGACGACGCTACGAAGCTGTTCGACGAAA 540 476 TGGTGTACATGTATGCCAGGTGTGTCCGCATTGACGACGCTACGAAGCTGTTCGACGAAA 535 159 L--V--Y--M--Y--A--R--C--V--R--I--D--D--A--T--K--L--F--D--E-- 178 541 TGGCTGAGAGGGACGTTATCACGTGGACTGCGGTGGTCTCTGGGTGCGTTCGGAATGGCG 600 536 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A--C--C--H--A--G--Y--V--D--E--G--R--K--L--F--I--R--M--G--E-- 658 1981 ATTGCCTTGAACCTAACCTGAAACATTACGCATGTATGGTGGATCTCCTAGGGAAATCTG 2040 1976 ATTGCCTTGAACCTAACCTGAAACATTACGCATGTATGGTGGATCTCCTAGGGAAATCTG 2035 659 Y--C--L--E--P--N--L--K--H--Y--A--C--M--V--D--L--L--G--K--S-- 678 2041 GGCATCTTCAAGAAGCAGAAGATATGATTTTGGCTATGCCAATACAACCTGATGGTGGGG 2100 2036 GGCATCTTCAAGAAGCAGAAGATATGATTTTGGCTATGCCAATACAACCTGATGGTGGGG 2095 679 G--H--L--Q--E--A--E--D--M--I--L--A--M--P--I--Q--P--D--G--G-- 698 2101 TATGGGGAACTTTGCTTAGTGCCTGCAAAATGCATGACAATTTCAAGATGGGGTTAAGAG 2160 2096 TATGGGGAACTTTGCTTAGTGCCTGCAAAATGCATGACAATTTCAAGATGGGGTTAAGAG 2155 699 V--W--G--T--L--L--S--A--C--K--M--H--D--N--F--K--M--G--L--R-- 718 2161 TTGCAAAGAAAGCTTTTGCTTCTGACCCAGGAAATGATGGGTACTATATATTAATGTCGA 2220 2156 TTGCAAAGAAAGCTTTTGCTTCTGACCCAGGAAATGATGGGTACTATATATTAATGTCGA 2215 719 V--A--K--K--A--F--A--S--D--P--G--N--D--G--Y--Y--I--L--M--S-- 738 2221 ATTCATATGGTAGTGCTGAAAAATGGGATGAGATAGAGAAACTGAGAGACACGATGAAGA 2280 2216 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