Transcript: HORVU.WBDC237.PROJ.1HG00008460.1
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- HORVU.WBDC237.PROJ.1HG00008460.1 1395 464aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG AAG GAG GAG CCG CCG CAC CCG CAT GCC CAT GGC GCC GCC GCC GCC GCC CCT CCT CCT 60
1 ATGAAGGAGGAGCCGCCGCACCCGCATGCCCATGGCGCCGCCGCCGCCGCCCCTCCTCCT 60
1 -M--K--E--E--P--P--H--P--H--A--H--G--A--A--A--A--A--P--P--P- 20
61 AG G GCA CGG CTG GGA GAT GAA CAT GGA TCT ACT TCT GTG TAT CGT GTT GGC GCA CTG GAG 120
61 AGGGCACGGCTGGGAGATGAACATGGATCTACTTCTGTGTATCGTGTTGGCGCACTGGAG 120
21 -R--A--R--L--G--D--E--H--G--S--T--S--V--Y--R--V--G--A--L--E- 40
121 AAG GCG ATC GCA GGG TTT GCA CAG AGG GAA ACT GAG GCC GTG GTC AAT CCA ACT GTT GGG 180
121 AAGGCGATCGCAGGGTTTGCACAGAGGGAAACTGAGGCCGTGGTCAATCCAACTGTTGGG 180
41 -K--A--I--A--G--F--A--Q--R--E--T--E--A--V--V--N--P--T--V--G- 60
181 AGT TCC TTC GTT TCT CTT GAC GAG GCA TAT GAA TTC TAC AAC ATT TAT TCT TGG GAA TCT 240
181 AGTTCCTTCGTTTCTCTTGACGAGGCATATGAATTCTACAACATTTATTCTTGGGAATCT 240
61 -S--S--F--V--S--L--D--E--A--Y--E--F--Y--N--I--Y--S--W--E--S- 80
241 GGT TTC GGA GTT AGG TAT GGA GCG GGT AGT ATG GAT TCT CAT GGT ACT AAA TGC ATA CAG 300
241 GGTTTCGGAGTTAGGTATGGAGCGGGTAGTATGGATTCTCATGGTACTAAATGCATACAG 300
81 -G--F--G--V--R--Y--G--A--G--S--M--D--S--H--G--T--K--C--I--Q- 100
301 CAA TTT GTT TGC GCG TGT GAG GGG AAA CCA ACC AAG GAA AGC AAT TCA TTT TGT CGG TGT 360
301 CAATTTGTTTGCGCGTGTGAGGGGAAACCAACCAAGGAAAGCAATTCATTTTGTCGGTGT 360
101 -Q--F--V--C--A--C--E--G--K--P--T--K--E--S--N--S--F--C--R--C- 120
361 GAA TGC ACA GCG TCG ATT CTT TTG CTG AGA TCC AGA GAT GGC AGA TGG CGC GTG TGC GAG 420
361 GAATGCACAGCGTCGATTCTTTTGCTGAGATCCAGAGATGGCAGATGGCGCGTGTGCGAG 420
121 -E--C--T--A--S--I--L--L--L--R--S--R--D--G--R--W--R--V--C--E- 140
421 CAT CAA GTC GGG CAT AAC CAT CCA CTA TCT AAG ATG TGT GTG CAG AGG TCA TCT TGG CAG 480
421 CATCAAGTCGGGCATAACCATCCACTATCTAAGATGTGTGTGCAGAGGTCATCTTGGCAG 480
141 -H--Q--V--G--H--N--H--P--L--S--K--M--C--V--Q--R--S--S--W--Q- 160
481 TCT CAC AGT AGT ATT GAC AAG AAC ACA AGG GAA TTG ATT CGC CAG CTT AGG GAA AAT AAT 540
481 TCTCACAGTAGTATTGACAAGAACACAAGGGAATTGATTCGCCAGCTTAGGGAAAATAAT 540
161 -S--H--S--S--I--D--K--N--T--R--E--L--I--R--Q--L--R--E--N--N- 180
541 GTG CCA CAC ATT TCT GAT ATT GAA GCA ACG AAC TCG CTG TCT GAT GAT ATC CAG AAG ACT 600
541 GTGCCACACATTTCTGATATTGAAGCAACGAACTCGCTGTCTGATGATATCCAGAAGACT 600
181 -V--P--H--I--S--D--I--E--A--T--N--S--L--S--D--D--I--Q--K--T- 200
601 GGG AAA ACC TTT GCT AGG ATC AAA GCA AAG GAT GCA ACA TTC GAT TAT ACC GGT TTG CAG 660
601 GGGAAAACCTTTGCTAGGATCAAAGCAAAGGATGCAACATTCGATTATACCGGTTTGCAG 660
201 -G--K--T--F--A--R--I--K--A--K--D--A--T--F--D--Y--T--G--L--Q- 220
661 CTT GAT AGT AAC TGT AGA ATA AGG CCA CTA CTC TGG ACC AGT GGC AAG GGC CTT CAG TAC 720
661 CTTGATAGTAACTGTAGAATAAGGCCACTACTCTGGACCAGTGGCAAGGGCCTTCAGTAC 720
221 -L--D--S--N--C--R--I--R--P--L--L--W--T--S--G--K--G--L--Q--Y- 240
721 CAA TAC TTT GGC GAT GTG ATT ATC TTC GAC ACC ACC TAC AGA TCG GAC AAG TAT GGA GCG 780
721 CAATACTTTGGCGATGTGATTATCTTCGACACCACCTACAGATCGGACAAGTATGGAGCG 780
241 -Q--Y--F--G--D--V--I--I--F--D--T--T--Y--R--S--D--K--Y--G--A- 260
781 CCG TTC GGC CTT TTT GTT GGA GTC AAC AAC AAC TTT GAG ACC ATA TTG CTT GGT GGG GTG 840
781 CCGTTCGGCCTTTTTGTTGGAGTCAACAACAACTTTGAGACCATATTGCTTGGTGGGGTG 840
261 -P--F--G--L--F--V--G--V--N--N--N--F--E--T--I--L--L--G--G--V- 280
841 CTA ATG ATA GAC GAG AAA ATG GAG AGC TAC AAA TGG GTG CTT AGT CAG TTC TTC CAA CTA 900
841 CTAATGATAGACGAGAAAATGGAGAGCTACAAATGGGTGCTTAGTCAGTTCTTCCAACTA 900
281 -L--M--I--D--E--K--M--E--S--Y--K--W--V--L--S--Q--F--F--Q--L- 300
901 ATA GGC CAG GAA CAC CCT AAA ACT ATA CTG ACT G A T CGC TGC GAG GCA ATT GAG GAA GCC 960
901 ATAGGCCAGGAACACCCTAAAACTATACTGACTGATCGCTGCGAGGCAATTGAGGAAGCC 960
301 -I--G--Q--E--H--P--K--T--I--L--T--D--R--C--E--A--I--E--E--A- 320
961 ATA TTG GAC GAG ATC TAT GAG GTG CGG CAC AAG TGG GTC AAG GCA TAC TTC AGT GAC ACG 1020
961 ATATTGGACGAGATCTATGAGGTGCGGCACAAGTGGGTCAAGGCATACTTCAGTGACACG 1020
321 -I--L--D--E--I--Y--E--V--R--H--K--W--V--K--A--Y--F--S--D--T- 340
1021 ATC TGT GCT ACA CTG ATC ACC AGC ACA CAA AAG AGC GAC TGC GCG AAA CGC TTT CTG AAA 1080
1021 ATCTGTGCTACACTGATCACCAGCACACAAAAGAGCGACTGCGCGAAACGCTTTCTGAAA 1080
341 -I--C--A--T--L--I--T--S--T--Q--K--S--D--C--A--K--R--F--L--K- 360
1081 CAA CAT CAT GTT CCA CGG GAT TGC TCA ATG GAG CTT TTC GCC GAA CAG TCC GAG AAA TTG 1140
1081 CAACATCATGTTCCACGGGATTGCTCAATGGAGCTTTTCGCCGAACAGTCCGAGAAATTG 1140
361 -Q--H--H--V--P--R--D--C--S--M--E--L--F--A--E--Q--S--E--K--L- 380
1141 TGG TCC GAT CAA CAA CGG GAC TAT GGG TTT CAG GAG CAG AGG ACT ACT GTG G AT GAT ACT 1200
1141 TGGTCCGATCAACAACGGGACTATGGGTTTCAGGAGCAGAGGACTACTGTGGATGATACT 1200
381 -W--S--D--Q--Q--R--D--Y--G--F--Q--E--Q--R--T--T--V--D--D--T- 400
1201 GTT CTG AGA ACA AAT CTG CCA ATC GAG AAG CAT GCC AGC GAG GTG TAC ACA AGA CCG GTG 1260
1201 GTTCTGAGAACAAATCTGCCAATCGAGAAGCATGCCAGCGAGGTGTACACAAGACCGGTG 1260
401 -V--L--R--T--N--L--P--I--E--K--H--A--S--E--V--Y--T--R--P--V- 420
1261 TAC GAA CAG TTT GTG CAA GCC ATA CAC GAA TCC GAA CCT TAC GTG GTG GAC GCA GTC GTG 1320
1261 TACGAACAGTTTGTGCAAGCCATACACGAATCCGAACCTTACGTGGTGGACGCAGTCGTG 1320
421 -Y--E--Q--F--V--Q--A--I--H--E--S--E--P--Y--V--V--D--A--V--V- 440
1321 CCT AAC TCA AGG TAC ATA GCG CGG CAT CCC AGC AGT GAA ACT AGG GAG AAT GGT CTA GGG 1380
1321 CCTAACTCAAGGTACATAGCGCGGCATCCCAGCAGTGAAACTAGGGAGAATGGTCTAGGG 1380
441 -P--N--S--R--Y--I--A--R--H--P--S--S--E--T--R--E--N--G--L--G- 460
1381 TGG AAT ATG AGG TGA 1395
1381 TGGAATATGAGGTGA 1395
461 -W--N--M--R--*- 464
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