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Hordeum vulgare WBDC237 (Hvulgare_WBDC_237_BPGv2)
About this transcript

This transcript has 6 exons and is annotated with 3 domains and features.

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeFlags
-HORVU.WBDC237.PROJ.1HG00008460.11395464aa
 
Protein coding
Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
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Other
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     1 ATGAAGGAGGAGCCGCCGCACCCGCATGCCCATGGCGCCGCCGCCGCCGCCCCTCCTCCT     60
     1 ATGAAGGAGGAGCCGCCGCACCCGCATGCCCATGGCGCCGCCGCCGCCGCCCCTCCTCCT     60
     1 -M--K--E--E--P--P--H--P--H--A--H--G--A--A--A--A--A--P--P--P-     20

                                                                          
    61 AGGGCACGGCTGGGAGATGAACATGGATCTACTTCTGTGTATCGTGTTGGCGCACTGGAG    120
    61 AGGGCACGGCTGGGAGATGAACATGGATCTACTTCTGTGTATCGTGTTGGCGCACTGGAG    120
    21 -R--A--R--L--G--D--E--H--G--S--T--S--V--Y--R--V--G--A--L--E-     40

                                                                          
   121 AAGGCGATCGCAGGGTTTGCACAGAGGGAAACTGAGGCCGTGGTCAATCCAACTGTTGGG    180
   121 AAGGCGATCGCAGGGTTTGCACAGAGGGAAACTGAGGCCGTGGTCAATCCAACTGTTGGG    180
    41 -K--A--I--A--G--F--A--Q--R--E--T--E--A--V--V--N--P--T--V--G-     60

                                                                          
   181 AGTTCCTTCGTTTCTCTTGACGAGGCATATGAATTCTACAACATTTATTCTTGGGAATCT    240
   181 AGTTCCTTCGTTTCTCTTGACGAGGCATATGAATTCTACAACATTTATTCTTGGGAATCT    240
    61 -S--S--F--V--S--L--D--E--A--Y--E--F--Y--N--I--Y--S--W--E--S-     80

                                                                          
   241 GGTTTCGGAGTTAGGTATGGAGCGGGTAGTATGGATTCTCATGGTACTAAATGCATACAG    300
   241 GGTTTCGGAGTTAGGTATGGAGCGGGTAGTATGGATTCTCATGGTACTAAATGCATACAG    300
    81 -G--F--G--V--R--Y--G--A--G--S--M--D--S--H--G--T--K--C--I--Q-    100

                                                                          
   301 CAATTTGTTTGCGCGTGTGAGGGGAAACCAACCAAGGAAAGCAATTCATTTTGTCGGTGT    360
   301 CAATTTGTTTGCGCGTGTGAGGGGAAACCAACCAAGGAAAGCAATTCATTTTGTCGGTGT    360
   101 -Q--F--V--C--A--C--E--G--K--P--T--K--E--S--N--S--F--C--R--C-    120

                                                                          
   361 GAATGCACAGCGTCGATTCTTTTGCTGAGATCCAGAGATGGCAGATGGCGCGTGTGCGAG    420
   361 GAATGCACAGCGTCGATTCTTTTGCTGAGATCCAGAGATGGCAGATGGCGCGTGTGCGAG    420
   121 -E--C--T--A--S--I--L--L--L--R--S--R--D--G--R--W--R--V--C--E-    140

                                                                          
   421 CATCAAGTCGGGCATAACCATCCACTATCTAAGATGTGTGTGCAGAGGTCATCTTGGCAG    480
   421 CATCAAGTCGGGCATAACCATCCACTATCTAAGATGTGTGTGCAGAGGTCATCTTGGCAG    480
   141 -H--Q--V--G--H--N--H--P--L--S--K--M--C--V--Q--R--S--S--W--Q-    160

                                                                          
   481 TCTCACAGTAGTATTGACAAGAACACAAGGGAATTGATTCGCCAGCTTAGGGAAAATAAT    540
   481 TCTCACAGTAGTATTGACAAGAACACAAGGGAATTGATTCGCCAGCTTAGGGAAAATAAT    540
   161 -S--H--S--S--I--D--K--N--T--R--E--L--I--R--Q--L--R--E--N--N-    180

                                                                          
   541 GTGCCACACATTTCTGATATTGAAGCAACGAACTCGCTGTCTGATGATATCCAGAAGACT    600
   541 GTGCCACACATTTCTGATATTGAAGCAACGAACTCGCTGTCTGATGATATCCAGAAGACT    600
   181 -V--P--H--I--S--D--I--E--A--T--N--S--L--S--D--D--I--Q--K--T-    200

                                                                          
   601 GGGAAAACCTTTGCTAGGATCAAAGCAAAGGATGCAACATTCGATTATACCGGTTTGCAG    660
   601 GGGAAAACCTTTGCTAGGATCAAAGCAAAGGATGCAACATTCGATTATACCGGTTTGCAG    660
   201 -G--K--T--F--A--R--I--K--A--K--D--A--T--F--D--Y--T--G--L--Q-    220

                                                                          
   661 CTTGATAGTAACTGTAGAATAAGGCCACTACTCTGGACCAGTGGCAAGGGCCTTCAGTAC    720
   661 CTTGATAGTAACTGTAGAATAAGGCCACTACTCTGGACCAGTGGCAAGGGCCTTCAGTAC    720
   221 -L--D--S--N--C--R--I--R--P--L--L--W--T--S--G--K--G--L--Q--Y-    240

                                                                          
   721 CAATACTTTGGCGATGTGATTATCTTCGACACCACCTACAGATCGGACAAGTATGGAGCG    780
   721 CAATACTTTGGCGATGTGATTATCTTCGACACCACCTACAGATCGGACAAGTATGGAGCG    780
   241 -Q--Y--F--G--D--V--I--I--F--D--T--T--Y--R--S--D--K--Y--G--A-    260

                                                                          
   781 CCGTTCGGCCTTTTTGTTGGAGTCAACAACAACTTTGAGACCATATTGCTTGGTGGGGTG    840
   781 CCGTTCGGCCTTTTTGTTGGAGTCAACAACAACTTTGAGACCATATTGCTTGGTGGGGTG    840
   261 -P--F--G--L--F--V--G--V--N--N--N--F--E--T--I--L--L--G--G--V-    280

                                                                          
   841 CTAATGATAGACGAGAAAATGGAGAGCTACAAATGGGTGCTTAGTCAGTTCTTCCAACTA    900
   841 CTAATGATAGACGAGAAAATGGAGAGCTACAAATGGGTGCTTAGTCAGTTCTTCCAACTA    900
   281 -L--M--I--D--E--K--M--E--S--Y--K--W--V--L--S--Q--F--F--Q--L-    300

                                                                          
   901 ATAGGCCAGGAACACCCTAAAACTATACTGACTGATCGCTGCGAGGCAATTGAGGAAGCC    960
   901 ATAGGCCAGGAACACCCTAAAACTATACTGACTGATCGCTGCGAGGCAATTGAGGAAGCC    960
   301 -I--G--Q--E--H--P--K--T--I--L--T--D--R--C--E--A--I--E--E--A-    320

                                                                          
   961 ATATTGGACGAGATCTATGAGGTGCGGCACAAGTGGGTCAAGGCATACTTCAGTGACACG   1020
   961 ATATTGGACGAGATCTATGAGGTGCGGCACAAGTGGGTCAAGGCATACTTCAGTGACACG   1020
   321 -I--L--D--E--I--Y--E--V--R--H--K--W--V--K--A--Y--F--S--D--T-    340

                                                                          
  1021 ATCTGTGCTACACTGATCACCAGCACACAAAAGAGCGACTGCGCGAAACGCTTTCTGAAA   1080
  1021 ATCTGTGCTACACTGATCACCAGCACACAAAAGAGCGACTGCGCGAAACGCTTTCTGAAA   1080
   341 -I--C--A--T--L--I--T--S--T--Q--K--S--D--C--A--K--R--F--L--K-    360

                                                                          
  1081 CAACATCATGTTCCACGGGATTGCTCAATGGAGCTTTTCGCCGAACAGTCCGAGAAATTG   1140
  1081 CAACATCATGTTCCACGGGATTGCTCAATGGAGCTTTTCGCCGAACAGTCCGAGAAATTG   1140
   361 -Q--H--H--V--P--R--D--C--S--M--E--L--F--A--E--Q--S--E--K--L-    380

                                                                          
  1141 TGGTCCGATCAACAACGGGACTATGGGTTTCAGGAGCAGAGGACTACTGTGGATGATACT   1200
  1141 TGGTCCGATCAACAACGGGACTATGGGTTTCAGGAGCAGAGGACTACTGTGGATGATACT   1200
   381 -W--S--D--Q--Q--R--D--Y--G--F--Q--E--Q--R--T--T--V--D--D--T-    400

                                                                          
  1201 GTTCTGAGAACAAATCTGCCAATCGAGAAGCATGCCAGCGAGGTGTACACAAGACCGGTG   1260
  1201 GTTCTGAGAACAAATCTGCCAATCGAGAAGCATGCCAGCGAGGTGTACACAAGACCGGTG   1260
   401 -V--L--R--T--N--L--P--I--E--K--H--A--S--E--V--Y--T--R--P--V-    420

                                                                          
  1261 TACGAACAGTTTGTGCAAGCCATACACGAATCCGAACCTTACGTGGTGGACGCAGTCGTG   1320
  1261 TACGAACAGTTTGTGCAAGCCATACACGAATCCGAACCTTACGTGGTGGACGCAGTCGTG   1320
   421 -Y--E--Q--F--V--Q--A--I--H--E--S--E--P--Y--V--V--D--A--V--V-    440

                                                                          
  1321 CCTAACTCAAGGTACATAGCGCGGCATCCCAGCAGTGAAACTAGGGAGAATGGTCTAGGG   1380
  1321 CCTAACTCAAGGTACATAGCGCGGCATCCCAGCAGTGAAACTAGGGAGAATGGTCTAGGG   1380
   441 -P--N--S--R--Y--I--A--R--H--P--S--S--E--T--R--E--N--G--L--G-    460

                                                                          
  1381 TGGAATATGAGGTGA                                                1395
  1381 TGGAATATGAGGTGA                                                1395
   461 -W--N--M--R--*-                                                 464