We need your help! Has Ensembl saved you time or effort? Please take 15 minutes to fill in a survey and help EMBL-EBI make the case for why open data resources are critical to life science research.
https://www.surveymonkey.com/r/QGFMBH8?channel=[webpage]

In this section

Statistics on protein trees

The protein tree pipeline is described at the following page.

This page provides a summary of the Ensembl phylogenetic analysis of protein families. The following views are available:

Statistics about the gene tree nodes

Species# Nodes# speciation nodes# duplication nodes# dubious nodesNode typesAverage duplication confidence scoreAverage duplication confidence score (non-dubious nodes)
Eukaryotes (Eukaryota)657548281270477
22.1 %30.4 %
Red algae (Rhodophyta)29792700161118
31.2 %54.0 %
Bangiophyceae23262280460
68.5 %68.5 %
Eukaryotes (Eukaryota)14590117951943852
12.6 %18.2 %
Animals and Fungi (Opisthokonta)187217554968
17.9 %42.9 %
Bilateral animals (Bilateria)69846010509465
25.7 %49.2 %
Chordates (Chordata)444542781670
66.8 %66.8 %
Arthropods and nematodes (Ecdysozoa)36563585710
72.5 %72.5 %
Charophyte/embryophyte group (Streptophytina)828362581478547
15.2 %20.9 %
Land plants (Embryophyta)221271788130241222
20.0 %28.1 %
Vascular plants (Tracheophyta)811065241418168
24.7 %27.7 %
Flowering plants (Magnoliopsida)113217769852595110281
15.8 %22.0 %
Petrosaviidae146541157219371145
19.1 %30.3 %
Petrosaviidae334642735628253283
15.6 %33.8 %
commelinids10220176940209174344
28.8 %34.7 %
Eragrostis301272383862890
69.4 %69.4 %
BEP clade (BOP clade)27186256051161420
20.3 %27.7 %
Oryzinae25585224732277835
32.2 %44.0 %
Oryza2252121403937181
35.4 %42.2 %
Oryza27711249952097619
32.2 %41.7 %
Oryza954428018863398915
15.4 %37.2 %
Oryza422213678413554082
9.5 %38.0 %
Oryza1753417454800
60.6 %60.6 %
Oryza37943344037352805
9.1 %43.7 %
Oryza1591315863500
58.0 %58.0 %
Oryza18865187091560
57.4 %57.4 %
Pooideae26313228643225224
39.4 %42.2 %
Pooideae132118107856209183344
36.1 %41.9 %
Triticinae158557128287242206050
36.4 %45.5 %
Triticum224211130
65.4 %65.4 %
Triticinae589555747314820
73.3 %73.3 %
Triticum11534911069746520
60.1 %60.1 %
Triticum297712678417621225
27.1 %45.9 %
Triticum11537811234030380
60.9 %60.9 %
Oats (Avena sativa)7863744932337050
86.1 %86.1 %
Panicoideae1333651256157568182
53.6 %54.9 %
Andropogoneae260981973025413827
13.7 %34.4 %
Fodder cane (Saccharum spontaneum)18784178319530
55.4 %55.4 %
Andropogoneae15847153345130
55.5 %55.5 %
Pentapetalae106518756731432816517
8.2 %17.6 %
Asteridae (asterids)1177061131124473121
44.9 %46.1 %
Daisy family (Asteraceae)464793904674330
75.1 %75.1 %
Nightshade family (Solanaceae)4861040678786468
65.8 %66.4 %
Solanum210111916718440
72.7 %72.7 %
Oleeae4168927939137500
85.9 %85.9 %
rosids7600758804522511978
5.9 %19.4 %
fabids815877734728491391
18.8 %28.0 %
Fagales630275406789600
78.4 %78.4 %
50 kb inversion clade1041329108812297747
49.3 %52.3 %
Trifolieae219162056313530
67.7 %67.7 %
Phaseoleae95393912354003155
52.8 %54.9 %
Vigna400963906910270
66.7 %66.7 %
Glycine subgen. Soja6078940769200200
91.5 %91.5 %
Fabeae443984155828400
69.8 %69.8 %
Rosales4709744598243861
54.4 %55.8 %
Amygdaloideae186141773087212
57.8 %58.6 %
Prunus445053995545500
70.0 %70.0 %
Malpighiales15212149053070
70.7 %70.7 %
Benincaseae375613467528860
79.4 %79.4 %
malvids522895136089435
47.8 %49.7 %
Mallow family (Malvaceae)350643257424900
56.0 %56.0 %
Mustard family (Brassicaceae)1050568980814883365
56.1 %57.5 %
Arabidopsis486424629223500
67.0 %67.0 %
Brassica183607121805618020
54.4 %54.4 %
False flax (Camelina sativa)478424496328790
63.0 %63.0 %
Eucalypteae265772094756300
84.2 %84.2 %
Chenopodiaceae159751415118240
76.5 %76.5 %
Green algae (Chlorophyta)311030011090
61.5 %61.5 %